在满桂赶回辽阳的同一天，代善向皇太极发出了最后通牒，要么交出汗位，要么开战，皇太极根本没得选择，他知道就算此时交出汗位，代善也不会放过他，他只能选择拼死一搏。
三月十五日，代善军正式开拔，向赫图阿拉挺进。与此同时，在辽阳城里，满桂却陷入了困境之中。沈阳战役失败后，尽管杨涟替熊廷弼说尽了好话，但是在浙东党人不依不饶的攻势下，天启还是被迫将熊廷弼召回北京接受调查，袁崇焕则暂代熊廷弼成为了辽东经略。对于满桂，袁崇焕并不信任，“此人败军之际不思忠君，甘为建州阶下囚，而今复归，难保三心二意。”另一方面，对于皇太极的求援信，袁崇焕更加抵触，作为一个坚定的主战派，他巴不得皇太极和代善狗脑子都打出来，然后他便可以坐收渔翁之利。
但是杨涟却不这么认为，他在辽东呆了这么久，知道女真人的厉害，同时作为一个文官，他对征服不感兴趣，他更在意的是辽东的百姓，打了五年仗，多少人丁流离失所，多少田地荒草丛生，这幅破败景象让他感到心痛，如果辽东能保持稳定恢复生产，那何乐而不为呢？
在杨涟的坚持之下，皇太极的求援信被快马加鞭送到了北京城。此时的天启正在为熊廷弼的事情焦头烂额。浙东党人以失地丧兵的罪名要求将熊廷弼处死，齐楚党人自然是不愿意，两边为这事已经吵了好几天，天启没办法，只能暂时先将熊廷弼逮捕下狱，至于最后到底定不定罪，定什么罪，那后面再说。
三月十六日，皇太极的求援信送到了天启的手中，天启不敢怠慢，他意识到这是一个绝佳的机会，于是立刻找来六部尚书召开内阁扩大会议。
“朕刚刚收到建州新酋皇太极的求援信，让魏忠贤给大家念念。”
“……南朝北朝，往日虽历刀兵，然自我始，愿与天子重修于好，偃武息戈，伏民安泰。然我国中，有居心叵测者二三，不尊王命，妄兴兵灾，求助于天朝，实属无奈……”
魏忠贤念完，在座诸人脸色各异，大致分为三派，第一是主战派，不承认金国的地位，力求彻底消灭建州女真部。第二是主和派，认为可以利用这次机会，将承认金国的地位，同时将其重新纳入到朝贡体系中来。第三派是中间派，认为既不承认金国的地位，但同时也不过分地去招惹他，只需要趁此机会将沈阳和铁岭收复就可以了。
天启听着大臣们的议论，自己的心里却又另外一番算计。作为后世来人，他对东北的未来还是比较清楚的，从西伯利亚向东入侵的俄罗斯哥萨克，此时已经抵达贝加尔湖附近，再过十几年，他们的触角就会伸向黑龙江流域，而蒙古的林丹汗已经把科尔沁草原尽数收入囊中，如果此时将后金彻底按死，大明根本没有力量来接替它的统治，整个东北就会处于权利真空带，很可能会被蒙古人和俄国人东西瓜分。
后金必须存在，它既挡住了俄国人南下的道路，也挡住了蒙古人东进的道路，一个统一的、听话的金国符合大明此时的战略利益。
“朕以为，可以与金国议和，也可以借兵给皇太极，但是，金国必须要向大明称臣纳贡。”
“万岁，若不趁此时一劳永逸地解决辽东问题，一旦将来建州缓过劲来，再想解决，恐怕是难上加难了！”兵部尚书黄嘉善进言到。
“哪有什么一劳永逸的办法，灭了金国还会出来水国，灭了水国又会有土国，何时是个头？户部尚书李汝华何在？”
“臣在。”
“告诉大家国库现在还有多少银子。”
“回万岁，去年秋税过后，国库里到现在只余五十万两白银，各地粮仓尚存粮七百万石。”
“都听见了？”天启环顾群臣，“再不息兵，朕就要找你们借钱去打仗了。”
三月十八日，朝廷圣旨抵达辽阳，杨涟、袁崇焕跪迎，天启在圣旨中列明了三点要求，第一是要皇太极称臣纳贡，第二是要皇太极归还沈阳和铁岭，第三是要求皇太极不得再南下劫掠。有此三条，辽东可派遣援军入建州，便宜行事。
接到圣旨后，袁崇焕立刻兵分两路，一路北上直取沈阳，根据满桂带回来的消息，此时沈阳已经是一座空城，根本无人驻守。另一路则出抚顺关去往萨尔浒旧地，屯兵此处，如果皇太极接受条件，那就北上铁岭，助其平叛，如果不接受，那就南下赫图阿拉，趁火打劫。
三月十九日，满桂星夜兼程奔至赫图阿拉，此时皇太极已经率军去了古勒寨迎敌，满桂只得又向北折返。三月二十日，当满桂见到皇太极时，两军已经在古勒寨鏖战一天了。
“满将军回来，可否有好消息？”皇太极疲惫的脸上，写满了愁色。
“万岁同意借兵，但是有三个条件。”满桂一边吨吨喝水，一边复述圣旨。皇太极听完，陷入了沉思。
称臣纳贡都是虚的，倒也无所谓，但是要归还土地，这就难办了。“将军，这归还沈阳和铁岭，能否再商议一下。”
满桂急切地看着皇太极，“我自然可以慢慢谈，可是不知大汗还有几日可以虚度？”皇太极闻言一愣，长叹一声，“代善真罪人也。”随后点头同意了。满桂立刻返回了萨尔浒，三月二十一日，袁崇焕率领两万明军从萨尔浒直奔古勒寨。
皇太极与代善在此鏖战三日，两边互有胜负，但因为代善兵力始终是优势，拖下去终究会赢下来。三月二十二日，就在两军再次激战的时候，袁崇焕突然率军从代善身后杀到，百门大炮齐鸣，顿时将代善的大军轰得血肉横飞。皇太极见援军赶到，大喜过望，立刻命令全军压上。腹背受敌的代善知道大势已去，急急忙忙吹响收兵的号角，往东向清源逃去。
皇太极赶紧止住追杀残敌的兵将，都是女真兵，现在少死一个，将来就能多保存一分力量。三月二十三日，皇太极大军追至清源，此时代善手中兵马已不足万人。皇太极为了避免再死人，于是亲自书信一封，派人送入城中。
“……若贝勒肯放下刀箭，我必以国礼迎之。一应操办，悉如从前……”代善看了信，对皇太极的说法表示怀疑，可是如今自己被困在这清源城，横竖是一个死，不信又能怎么办呢。
三月二十四日，代善率阿敏等人向皇太极投降，皇太极却是心机，他虽然没有杀他们，但是却将其全部软禁于赫图阿拉城中，不许其踏出一步。同时借此机会，彻底撤销了四大贝勒轮流执政的体系，将权利全部收归大汗，同时效仿明朝内阁制，设立枢机处，如此，一举完成了后金的中央集权。
大明天启二年三月三十日，皇太极改元天聪，复立国号为清。
四月八日，皇太极向大明上顺表，递贡金十万。天启册封皇太极为清国国主，赐国主印。绵延五年的明金辽东边境战争暂时宣告结束。
