就在朱温把昭宗刚刚接回汴州没有多长时间，从汴州忽然传来了淄青的王师范兴兵进犯的消息，朱温听罢就想率军东还。他临行之前，留步行、骑兵入补神策军，以朱友伦为左军宿卫都指挥使，部将张足范为宫苑使，王殷为皇城使，从而完全控制了长安及周围地区。作完这一切之后，朱温又上奏昭宗道：“克用与臣本无大怨，只是稍有误会而已，从而连连兴兵，民不聊生，现幸误会已解，请陛下为克用加官晋爵，并遣大臣前往抚慰。”昭宗听了之后马上诏准。可是李克用听到这个消息之后，却嘿嘿冷笑道：“好个狡猾的朱温，他欲出兵淄青，却又害怕我出兵攻其后路，想以此来笼络我。
”李克用还真的猜对了，并且还真的想这么做，怎奈此时他已经兵力单薄，根本就无力进攻汴州了。在三月，朱温回到了汴州，马上就组织对淄青的进攻。其实这淄青节度使王师范本来是依附于汴州，人是去年在朱温率军围攻凤翔的时候，韩全海曾派人向各个藩镇去求救。而王师范见朱温留在关中迟迟未返，关中地区十分的空虚，便想趁此机会来扩大自己的地盘。他让自己的部将分别率士卒化妆成商贩，推起了送货的小车子，武器全部藏在了车里面，然后别分别赶赴于汴、徐、兖、郓、齐、沂、洛阳、孟、滑、河中、陕、虢华各州，并且约定好了日期，同时行动，但是大部分人马还未行动就被识破了，并且束手就擒，只有行军司马刘寻顺利地攻取了兖州。
留守于汴州的节度官裴迪得知这个消息之后，心中异常着急，但事情紧急，已经来不及禀报朱温了，便请马步都指挥使朱友宁与泰宁节度使葛从周共同进攻王师范的大军。正在这个时候朱温已经返回了，便下令让朱友宁进攻青州，葛从周包围兖州，自己则率领大军十万作为后援，到了六月，汴军相继攻下淄青所属的博昌与临淄，并进抵登州、青州城下。不过登州一战，进行的并不顺利，汴军受挫，并且朱友宁战死疆场。朱温得到这个消息之后，恼怒异常，率军昼夜赶赴青州，立誓要一举攻下青州，活捉王师范为朱友宁报仇。但青州城坚兵强，朱温未能如愿，遂留下了自己的部将杨师厚主持对青州的进攻，自己又回到了汴州。到了九月，王师范眼见自己的属地多为汴军所战，自己只剩下了这么一座空城，遂向杨师厚投降。朱温此时依旧在担心着长安城里的情况，他害怕关中的李茂贞会趁着他不在再次劫持昭宗，因此，他接受了王师范的投降，仍命他镇守青州，自己则作好准备将昭宗迎至洛阳，把昭宗圈在自己的势力范围之内，这样他才可以放得下心。
再说朱温虽然在离开长安的时候就预先作了安排，但他留下的军队还不是凤翔李茂贞的对手，况且，崔胤自从朱温走后，也暗自来扩大自己的势力，借口长安邻近凤翔，四处招募士卒来充当禁军。朱温对此早就已经识破了，便暗暗派汴军将士前去应募，可叹崔胤还蒙在鼓里不知呢！在十月里，朱温留在长安典掌宿卫的朱友伦在击毯球的时候突然落马身亡，朱温对此抱有怀疑的态度，他怀疑是崔胤谋害的，但苦于无有证据，只得派人去将陪同朱友伦一起击毯球的十余人全部杀掉，又派义子朱友谅代替朱友伦的位子。经过了这件事之后，朱温更加迫切的想要把昭宗迁到洛阳了。在公元904年正月初，朱温上表昭宗，称宰相崔胤专权乱国，离间君臣之间的关系，理应诛除。昭宗接到奏表之后，随即想起了自己那年在凤翔所受到的一切苦难，全都是这个崔胤所引起的，不由的怒从心头起，随即罢崔胤宰相，降其为太子少傅。朱温又密令朱友谅将崔胤杀死于家中。然后亲率大军进屯河中，派出牙将寇彦卿向昭宗上表，请迁都于洛阳。接着又致书裴枢，要他率百官东行，到了二十七日，昭宗由长安出发，朱温令原留在长安的部将张廷范为御营使，率军护卫。
到了二月十日，昭宗及大批随从缓缓到达了陕州。次日，朱温至陕州朝见昭宗。因为洛阳的皇宫还没有修好，便要求昭宗暂住在陕州。三月，朱温声称要亲往洛阳督修宫室，临行前置酒与昭宗等宴饮，宴后，照常宗留朱温与前华州刺史韩建畅饮。皇后何氏亲自为朱温斟酒。在一旁的韩建偷眼看到晋国夫人附在昭宗的耳帝轻声说了一些什么，而且昭宗还不住的点着头，便心里一动，就用脚踩了朱温一下。朱温警觉之下，顺着韩建的目光看过去，也发现了那一幕，以为昭宗要谋害自己，心底大惊，遍体生寒，思忖自己该怎么办，忽然他摇摇晃晃的站起身来走到昭宗的面前说道：“陛下，臣臣不胜酒力，先先下去了。
”然后也不等昭宗答应，便跌跌撞撞的走出门外，守在门口的禁军哪里敢拦他，只得任其夺门而去。到了四月，朱温上表称宫室已经造成，请昭宗尽早入洛阳。昭宗因为此时何皇后新产皇子，便要求十月再往洛阳。朱温认为昭宗是借故拖延，不肯前来，大怒之下，命令寇彦卿道：“你速速前去陕州，即日催促皇帝上路，如果不从，你可自便。”寇彦卿领命来到了陕州，软中带硬的请求昭宗上路，昭宗无奈之下只得上路，在途中，朱温又下令杀掉晋国夫人以及宫里所有的侍从，全部换上了自己选定的人员。昭宗看到这一切，不由得悲从心来，他满以为自己被朱温从凤翔救出之后，可以由危转安，没有想到才出虎穴又入狼窝，这个朱温比那个李茂贞还要狠毒。
