故事回到三十年前，药王谷，座落于玉山之中，谷中有很多种蛇，还有一种大鸟，外貌似猫头鹰，好捕食蛇类，且与人类友好，与大鸟关系度达到一定程度，它便会甘愿做你的坐骑。
谷内有一位归隐的御医名叫卫仲，从小就对医药非常感兴趣，且很有天赋，被药王左青收为独徒，后被朋友举荐为御医入宫，因看不惯宫中的迂腐荒淫，便辞官回到药王谷，跟师父继续研习医术，后来左青去世，便留下卫仲一人。
相传卫仲经常骑着大鸟下山，免费为穷人看病，被周围百姓亲切的尊称为卫神医。
卫仲快四十岁时方才成亲，婚后夫妻十分恩爱。
一年以后，生下一女，卫仲为女儿取名卫妮，然而卫妮出生后不到一年，其妻便得怪病于家中猝死，其症状以及医学前科，连卫仲自己这么高明的医术，也是闻所未闻。
卫仲很无奈，却无法接受这个现实，于是他将妻子冰封，多年来一直在研制灵丹妙药，希望能将妻子起死回生。
一转眼二十年过去了，他始终没有救活挚爱的妻子，而女儿却长大成人了。
山下有一个孝子，名叫曾无极，据说他似乎命很硬，刚一出生不久父亲便莫名死去，母亲独自一人将其拉扯大，省吃俭用，终因过度劳累和饮食问题，导致身患多种顽疾，终日卧床不起，以药物续持着生命。
曾无极就到处做苦力赚钱为母亲买药治病，后又到访药王谷，请来卫神医为其母看病。
卫仲经过望闻问切诊断之后，将曾无极带到屋外，叹息着告诉他，其母已病入骨髓，现在只能服用诸如红参之类的药物调治续命，随时会有生命危险，让其作好心理准备。
然而曾无极并没有放弃希望，他跪在地上肯求神医好好想想，一定有办法救自己的母亲，他愿作牛作马，万死不辞。
神医被其孝心感动，便告知他以后每三天来药王谷免费拿药，珍惜这段有限的时光，好好的多尽尽孝道。
这往后，曾无极便每隔三天去神医家取药，一来二去的，便与卫妮渐渐熟悉，二人也很对眼，慢慢的互生情愫，感情与日俱增。
这日，两人在谷中散步，卫妮便唆使曾无极向其父亲提亲。
曾无极没有想到，卫妮先提出了这个请求，还有点受宠若惊，难得卫姑娘这么看得起自己，愿意托付终身于我，无奈自己家贫如洗，又有重病老娘卧床不起，实在感觉门不当户不对，一怕给不了卫妮任何东西，二怕神医看不起他，不会答应这门亲事，因此，他冲着卫妮摇了摇头。
见曾无极摇头，卫妮赶紧问道：“怎么，你不愿意娶我？”
曾无极赶紧答道：“不是，我是怕，我怕我向你父亲说了此事后，他不单单会拒绝我，还将我赶走，连我娘的药也不给我了，那就惨了。。。。。。”
眼见如此，卫妮也是无奈的说道：“算了吧，还是我自己来说吧！”
这日夜里，卫妮早早的准备了一桌好菜，一壶上好的药酒，名以犒劳父亲，实为商量自己与曾无极的亲事。
父女俩吃得正欢时，神医却先开口了：“妮啊，你妈走得早，你从小就没有感受过什么叫做母爱，而如此你又长大了，正所谓男大当婚，女大当嫁，爹也得替你找个婆家嫁出去，以免误你终身啊！”
卫妮听到此，虽然感到有些意外的惊喜，爹这样说不正好击中我的话题了吗，然而她突然却沉默了，因为想到自己嫁出去后，家里就只有爹一人，不禁哽咽的说道：“爹，女儿会侍奉你一辈子的，绝对不会离开你，要不，咱们可以招女婿上门呀！”最终卫妮还是说出了自己心里想说的话，这也算是个一举两得的美事。
卫仲微微一笑，喝掉杯中没喝完的半口酒：“那看样子，你是有意中人了，是曾无极？”
卫妮一时间羞愧得脸通红通红的：“爹，你怎么知道的？”
“你说你常年没离开过药王谷，就最近与曾无极有过接触，不是他又会是谁？要说这孩子天性善良，为人孝顺秉直，还算是个值得托付的人。”卫仲说完又倒了半杯酒。
“这么说，您是答应了！？”卫妮高兴的问道。
神医见卫妮这么开心，亦知女儿是真心喜欢曾无极，心中很是欣慰，便逗乐的问道：“我答应什么了？”
“爹。。。。。。”卫妮被逗得满脸通红，真恨不得找个缝钻进去。
就这样，曾无极便做了卫家的上门女婿，曾无极将自己的娘接进药王谷住下，一家人都可照顾，也算是过得其乐融融。
两人结婚后的第二年冬，生下一个女儿，因曾无极是入赘卫家，所以女孩取名卫轻歌。
后来，卫仲也不吝的将自己的毕生医学全部传授予曾无极。
一家三代人，小日子过得也算是蛮幸福的。
一转眼十年过去了，轻歌也十岁了，然而就在一家人开开心心，准备为轻歌庆生的前一晚，曾母病情恶化，神医亦无力回天，最终去世，一家人由喜转哀。
而此时最难过的却是卫仲，自己被人们尊称为神医，却只能眼睁睁的望着冰封里的妻子却无计可施，而如今又看着自己的亲家离去却无能为力。
于是，愧疚悲伤的卫神医将之前师父留给自己的所有书搬进了密室，他决意闭关研究本门失专已久的灵药--天御九转丹，此药能治百病，解百毒，甚至能让身体失去的部位重生。
而此时的白洛，正在赶往药王谷的路上。
他一路走，一路问，白日吃着携带的干粮赶路，夜里借宿在好心人的家中，可是每个人都告诉他最好不要去那里，那里太危险了，有好多的毒蛇咬人。
可是白洛才不管那些，心中只有人们指出的路径方向，其它的一切都不在乎，他坚信一个一遇到困难就退缩的人，永远是感受不到成功的喜悦的。
正走着，身后传来一阵马踏声，声势磅礴，雾尘弥漫，白洛扭头一看，一支浩荡的军队走向前方冲去，领队的有十多个骑马的，随后有一个圆形大轿，有16个人抬着，后面跟着的是铁甲兵，穿着铁甲，拿着长枪，队伍很长，一眼望去，没有边际。
小白洛哪见过这阵仗，一时间都惊呆了。
其实，眼前这路兵马，也是要赶往药王谷，他们是太子的近卫队。
最前面骑马的将军便是近卫队将军沈越，据说他曾是前傲剑山庄庄主的师弟，剑术超群，手中长剑寒光掠影，疾如闪电。
另外三个穿赤色衣服的，便是太子麾下“赤影”组织的三个统领，大统领擅使大刀，二统领擅使环，三统领是位美女，擅使鞭。
而坐在八抬大轿里的，正是当今太子--公子蓝，他此去药王谷的目的说出来有些尴尬，那就是他终日风流成性，患多种性病，每日疼痒难忍，宫中御医均束手无策，其一怒之下还斩杀了多名御医，更使得其它医者对其远而避之。
太子只得传令部下与赤影的人到处打听，然太子所患之病症，为多发类症状并起，从而产生的顽固性感染类疾病，经几处名医诊断，均表示无从下手。
最终，他们打听到药王谷有位卫神医，一行人便准备前往药王谷，求救于卫神医。
