李来亨见突围不成，只得死守，穆里玛见李来亨差点突围出去，又命众将死死围住，日夜攻打不停。此时义军伤亡特大，又快到弹尽粮绝的境地。清军吃够了苦头，不再大规模的攻打，而是分兵多路，小股偷袭，让义军日夜不得安宁。
六月十五日，李来亨见被清军围得水泄不通，山上实在难以为继，有些意志不坚定的兵士将领开始下山投降，能征战的部队越来越少，特别是童子营和女兵营非战斗减员相当严重。[李自成的农民军历来是一个整体，部队只十到十四岁的编到童子营，女人编到女兵营，军中同样迎娶婚嫁，自和外面的社会没什么区别。李来亨在兴山坚持抗清长达十三年，靠得是义军自给自足，自己发展生产，以前也曾领兵攻打湖北向东发展，但只为筹集粮饷，最后仍回兴山。]李来亨也知道长期坚守下去不是办法，还得突围，遂于六月中旬准备反击，实施突围。
穆里玛，李国英，图海等人，见李来亨内无粮草，外无救兵，又不得不再进行劝降，因茅麓山实在易守难攻，清军实在伤亡太大，自以为在强大攻势下，李来亨困难无计之时会投降。那料到李来亨又开始突围？
是夜，李来亨引五千人马为先锋，命李守信断后保护家属官眷，众营齐出杀下来，一时锣鼓震天，喊杀四起，李来亨一马当先，率部杀入敌阵，后军也一并跟上，欲杀开血路，向湖北境内突围，义军没有退路只有拼冲杀，清军人数占优，又备有火炮，弓箭对义军威胁机大，加上图海，郑蛟麟的八旗兵善战，李来亨虽率部殊死拼杀，却无法突出，而且被清军截成数段，形势十分不利，女兵营几近全营阵亡。
李来亨所率五千人马也伤亡过半，随时有全军覆没的危险，无奈之下只得翻身杀回，冲开清军，接应童子营，家属官眷，及各营人马退回茅麓山，伤亡近半人马，却突围失败。哀嚎遍野，惨不忍睹，义军已陷入绝境。李来亨心急如焚，可是也着实无计可施，两次突围也是突不出去，兵马折损无算只剩得些老弱病残。
闰六月初九日，李来亨又组织了一次突围，尽管义军拼死冲杀，却仍然没能冲出重围，山上粮草全部吃尽，已陷入绝境。到七月初，义军只能以草根树皮为食。李来亨见突围无望，便召众将到九莲坪帅府商议道；“我等自随先帝以来，数十年征战，先推前明暴政，再联合永历朝抗击清军，抵抗外侮，奈何苍天不佑！今中国已无寸土属明，唯我等在此死守。清兵势大，众将有何打算？”众将见事已至此，决心和清军决一死战，李来亨见状，不禁双目垂泪道；“既如此，只有死战了！”众将高呼“血战！”李来亨又道；“那也不能尽数死绝吧，得为我大顺军留一线血脉，遂将诸将有子者，各选一人。”命李守信带领，从茅麓山西南悬崖上用数十仗绳索放下，诸童尽剃头留辫。李来亨告李守信道；“前有李晋王部流落在滇，中原已无寸土安身，你即率诸子前往滇省，事急则可出缅，为我大顺军保存一丝血脉也！”李守信遂领命率十余人慢从悬崖下走脱，内中有一人即为李来亨子。由于沿路清军追查极严，故不得知姓名，最后李守信带这帮孩子流落到腾越州隐居下来。[如今云南腾冲人很多人都说是李自成后人，都认为大顺军后人归落在腾冲。]
七月下旬，茅麓山下各关隘全部失守，义军大多战死，清军也被打怕了，可是穆里玛，李国英，图海等人，兵马多，人数众，仍然死命攻打，义军英勇不屈，直致战死。
八月初三，清军已攻破各处营寨，只剩九莲坪李来亨的帅府和约两千人马，此时清军已攻到寨前，所幸义军仍凭险据守，清军仍不能破。便命李来亨部降将李有实来劝降，李来亨怒道；“我决心既下，宁战死而不降，命可丢，然大顺军气节决不能丢！你这等卖主求荣的叛徒，还敢来劝降？”李有实跪在地上拼命求饶，只见李来亨一刀斩下李有实的头道；“这就是降者的下场！”
是夜清将贺布索引一千清军，趁浓雾雨狂偷偷爬过寨墙率兵接近李来亨的帅府，被李来亨发现。李来亨即发起攻击，将贺布索这一千人马截成数段，一阵掩杀，战至半夜，尽将这一股清军杀尽，贺布索本是清军的高级将领，见外面清军攻不进来，自己被困知必死，索性把心一横，挥刀直取李来亨。
二人好一场恶战，一人拼命，十人难当。贺布索显然不是等闲之辈，刀法娴熟，攻防兼备，严然是一流将领。可这回他碰上了以“小闯王”著称的李来亨，可就在劫难逃了，五十合一过，贺布索招架不住了，被李来亨一枪刺中，李来亨取刀斩下贺布索的人头，挂在寨门前，以示和清军决战的决心。
可是，再看部众伤亡也不少，李来亨知道最后的时刻即将到来，遂将妻子，儿女全集中到帅府，做好了准备。命一名随从亲信将自己母亲送到山后一个小石洞中。
八月初四，义军战士们奋不顾身，死命抗击清军的“俱抬云梯、挨牌，用钩镢板斧砍桩拖堑，炮矢如雨，抵死攻打”，终因寡不敌众而未能成功。寨内已是弹尽粮绝，战至傍晚时，义军大多战死。李来亨见大势已去，将妻子杀死，房屋放火焚烧，自己飞身跳入火海。连同二个子女自焚。谱写了一曲可歌可泣的英雄壮歌！余众“四散奔出，俱被各路汛守官兵尽行擒斩。”随李来亨战死的将领二十二人。被清军所俘部众一百五十人。三万义军大多战死。至此，“夔东十三家”最后一支部队宣告覆灭。史称：“来亨败没，中原无寸土一民为明者，惟诸郑屯海外。”
李来亨，原名懋亨，陕西清涧人，生年无考。他是明末农民军领袖李自成族兄之子李过[李锦]的养子，也就是李自成侄孙。[也说是后来被李自成收为义子。由于清史多称李自成部为流寇，史中亦多详尽，且所载出入很大。]他在少年时即投身农民军，跟随祖父、父亲南征北战，在战火中成长为一名英勇善战的战将。李自成兵败山海关，先后撤出北京、西安，转战到湖北时，李来亨已崭露头角，与李自成麾下名将高一功、郝摇旗、刘体仁、袁宗第齐名，见载于历史文献。顺治二年（1645年）五月，李自成在通山九宫山被地方反动武装杀害后，其妻高夫人召集农民军20余万人，实现战略大转变，与南明政权合作，共同反抗带有民族征服性质的满洲贵族集团建立的清王朝。在江南、大西南残山剩水间建立起来的几个南明小朝廷，依然继承了明王朝腐朽的衣钵，奢侈腐化、宦官专权、党争犹酣，正如词曲大家吴梅在散曲中形容的那样，“江山如纸，宫门如市。小朝廷病入膏肓，经不起群雄狂噬。”顺治五年（1648年），抗清队伍中的军阀、野心家孙可望悍然围攻由贵州入蜀的高一功、党守素、贺锦、李来亨部，只有李来亨力战得脱，高一功等均被杀，南明抗清大业岌岌可危。“沧海横流，方显英雄本色。”李来亨挺身而出，继续高举抗清大旗，召集所部数万人，经过多次血战，最后在方圆一百五十余华里的茅麓山高山之上、密林深处，建立起抗清根据地。他实行屯田自给、予民休息的政策，关怀山中百姓疾苦，深得民心，都称他“小闯王”。他多次率兵出击，给清军以沉重打击。
清初诗人宋曹有诗赞曰；
应怜中土成荒寨，万里长风吹古愁。遗民泪尽胡尘里，中土再无大明旗！
当地人传说李来亨并没有牺牲，而是从一个不为清军所知的秘密小道逃走了。事实上，清初的一些史籍，也有类似记载。曾在永历朝廷任职的历史学家王夫之在所著《永历实录》中，记载李来亨部三万余人，除战死者外，均逃走。
“夔东十三家”是明末农民战争的余波，也是大顺军的最后阶段。当然也是名义上南明永历王朝的最后一部，他们继承了李自成时代大顺军不屈不挠、英勇斗争的优良传统，与清军进行了顽强的殊死战斗，表现出崇高的民族气节，许多人直到最后也宁死不屈，舍生取义，毫不妥协，谱写了一曲感天动地的英雄颂歌。随着李来亨的失败，明末农民战争彻底结束，整个大顺军及其抗清斗争悲壮地画上了句号，除台湾郑成功余部外，大陆以南明为旗号的抗清斗争终于也走到了尽头。清朝基本上完成了大陆的统一，中国历史进入了一个新的时期。
由于南明王朝的苟且偷安，内讧连连，终究难成气候。覆巢之下宁有完卵？“夔东十三家”独木难支，不可能扭转全国时局。另一方面来说，“夔东十三家”割据一隅的战略失于保守，束缚了自己的手脚。他们长期龟缩在川楚交界的夔巫山区，“扼险据冲，观衅而动”这也源于，李自成，张献忠时期的大规模的流动，最后导至失败。让“夔东十三家”各自打成保守的战略决策。三峡地虽然具备做为抗清的根据地，然而交通不便，人口不多，经济相对不发达。这也是“夔东十三家”失败的原因之一。
