论组织中谁的忠心程度最高，琴酒自然当仁不让。为确保组织的利益，他可以做出任何事情。
组织最大的研究基地被毁，研究资料全部消失。如果不做点什么，组织将永无翻身之日。现阶段，组织已没有能力去对那些叛逃者进行报复。
可是雪莉不一样。
雪莉本身就是组织的科学家，在叛徒前经营着APTX4869以及其他相关项目。更何况，她的母亲是宫野艾莲娜，组织核心项目的负责人。基地被毁后，组织怀疑宫野艾莲娜和研究资料并没有消失，她们也许被政府部门隐藏了起来。
所以，找到雪莉，应该就能顺藤摸瓜的找到宫野艾莲娜和研究资料。到时候，组织就可以完成逆转，卷土重来。
普通人看到一个送快递的从自己朋友家走出来，而且这个朋友又联系不上，第一反应肯定是有问题。灰原和纪海宏都发现了这个问题并且非常紧张，然后他们逃往别处。琴酒看清他们脸上惊恐的表情，更加认定自己没想多。他迅速跑到大门，开门，然后——看到雪莉和她的朋友坐上了一辆出租车。
没有关系，准备充分的琴酒怎么可能就这样放弃。他立刻坐上停放在路边的雪佛兰Blacksuburbans进行追击。出租车司机的技术不错，对周边地形也很熟悉，总是挑小路和捷径。琴酒的驾驶技术比一般人要高出许多，司机虽然可以借助地形与之周旋，但双方的车技差距是无法弥补的。
时间要是再拖延下去，保护雪莉的人就会赶来。琴酒不会给他们时间，不会放弃这个机会。他左手掏出手枪，右手掌握方向盘，手枪伸出窗外，对着出租车的方向。没有三点一线的瞄准，琴酒仍坐在驾驶室中，紧盯前面的猎物。
出租车开始转向。在这短暂的瞬间，琴酒扣动扳机。子弹打爆后轮胎，转向中的出租车失去控制，横撞到路边的护栏上。司机灵活地利用撞击，重新调整方向，避免引擎熄火的命运。即便如此，在后轮爆胎的情况下，车速还是慢了许多。
琴酒抓住机会，打爆了另一个后胎。轮毂发出刺耳的尖叫。雪佛兰撞向出租车的后方，把出租车的保险杠都撞歪了。两车的距离几乎消失，琴酒可以看到出租车的后窗。
直到这时，琴酒才发现，出租车的后窗贴有薄膜，从外面看不到里面。不过，雪莉应该在这辆车里瑟瑟发抖吧。
两声枪响打碎了琴酒的幻想，两枚子弹镶在雪佛兰的挡风玻璃上。就算挡风玻璃是防弹了，还是在子弹的强大动能下产生了蜘蛛纹。没想到对方有枪，视线又受阻，琴酒只能不断地撞击汽车，企图迫使出租车停下来。
如果琴酒能冷静下来，不把所有精力放在雪莉身上，他就能发现一件事：什么样的出租车司机遇到这样的情况还不停车？
出租车内，纪海宏打光子弹，重新更换弹匣。他笑着对灰原说：“果然防弹呀，琴酒这家伙还真不好对付。”
灰原有些不爽：“这个计划可真让我终生难忘。”
“都说啦我在你身边，外加尼克这个老司机，没问题啦！”更换完毕，纪海宏继续射击，阻碍琴酒的视线。枪声的分贝比鞭炮还要高，灰原不得不捂住耳朵。
尼克闻言回答：“放心吧女士，我们马上就到地方了。”
尼克所说的“地方”是一片毛坯楼，这些楼房刚刚建好，还没来得及给外墙装修。工人都在休息，等待新一批建筑材料到齐。
出租车驶入毛坯楼区域，爆开的后轮使汽车在凹凸不平的土路上颠簸得厉害。四面八方都是高楼，在没有路标的情况下，他们好像进入了一个简陋的迷宫。周围一个人都没有，只有黑洞洞的窗口注视着他们。
琴酒紧追不舍，他们开到一个比较开阔的地方。
高处传来枪声，雪佛兰左侧一歪，险些打了个趔趄。琴酒知道自己遭到狙击，他立刻倒车，开到楼道附近。
被枪声一惊，琴酒终于发现，自己好像踏入了一个圈套。
……
“我看到有人拿着枪，胁迫阿笠博士回到屋内，”赤井秀一打电话告诉柯南，“是琴酒，他有些伪装，可瞒不过我。”
柯南没有慌张，这么长时间，他多次模拟过这一天到来时可能采取的措施。身为侦探，他不喜欢被动，他喜欢在事情发生的时候立刻解决它。
安室透暴露后，柯南总是在心中担心组织会怀疑雪莉的死因有诈。他预见会有这一天，只是不知道这天什么时候到来。
既然这一天真的来临，他工藤新一，也不会怕。
琴酒去找阿笠博士，说明他进行了周密的调查，知道灰原住在阿笠博士家里。但是他不知道，灰原已经搬走了。在赤井秀一后续的监视中，柯南得知，孩子们来到阿笠博士家，发现没有人开门。安全起见，赤井秀一以冲矢昴的模样出现在孩子们面前，邀请他们做客，确保他们的生命安全。
柯南从种种迹象分析，琴酒现在还没出来，说明他在等灰原回来。他一定看到了这些孩子，并且认为孩子们会通知灰原，方便琴酒守株待兔。
此时，纪海宏和灰原也收到琴酒进入博士家的消息。灰原心急如焚，阿笠博士年事已高，琴酒心狠手辣。万一出了什么事该怎么办？纪海宏很着急，可是他们又不能贸然进攻。要是惹怒琴酒，定会危及博士的生命。
关键时刻，柯南提出万全之策。公安和FBI的支援太远，现在指望不上。而纪海宏的手下恰好有两支全副武装的机动特遣队随时听候差遣。他打算让纪海宏和灰原去博士家门前，装成打不开门的样子引琴酒出来，然后乘坐准备好的出租车逃跑。赤井秀一则埋伏在指定地点伏击琴酒，用一组机动特遣队封住他的退路。同时，另一组特遣队在琴酒离开后立刻营救阿笠博士，并侦查周边地区，看看是否还有其他组织同伙。
计划以灰原为诱饵，有些危险，但无论是灰原还是纪海宏，都愿意执行。先不说能不能消灭琴酒，他们是不可能眼睁睁地看着阿笠博士出事，博士一定在等人去救他。
琴酒的算盘打得很好，可惜一开始就失败了。因为他千算万算，没想到赤井秀一居然还活着，并且就住在阿笠博士的隔壁。
这场战争，是留给他们的，最终之战！
……
雪佛兰倒车的速度甚至比前进的速度还要快，车厢撞到楼梯边的柱子才停下来。琴酒放开座椅，爬到后方拿起武器。子弹如雨点般打来，纪海宏和尼克向雪佛兰开火压制琴酒，而后撤退。
不久之后，警察和自卫队会包围这里。他们会和机动特遣队协助封锁这片区域，直到战斗结束。
琴酒躲在建筑里，他能听到外面的动静。有人在呼叫，好像要包围这片区域。
这种小事儿给不了琴酒压力，让他胆战心惊的，是狙爆轮胎的人。这个人带给他久违的熟悉感，他的直觉告诉他，对面就是这个人。
可是，现实告诉他，这个人已经死了。
无论如何，对面有一名狙击手，这是事实。琴酒要是想活着离开这里，首先要杀掉这个狙击手。
琴酒装备的是MK11MOD0半自动步枪（配光学瞄准镜），另外还有M9手枪以及若干弹药。他与对面的建筑距离大概有五百米左右，正是这种精确射手步枪施展威力的好环境。
快速向楼顶奔跑，琴酒需要良好的视野和合适的攻击阵位。在上楼途中，外面又响起枪声。琴酒滑倒在墙边，看见子弹穿入水泥墙，溅出很多碎屑。
这片区域的建筑楼层都是十三层，此时琴酒正在第七层。从刚才子弹的落点，敌人应该在第九到第十层之间。
赤井秀一的确在第十层，他透过瞄准镜中的V型准星发现琴酒的身影。虽然没有击中琴酒，但看清了琴酒手中的武器。与琴酒不同，他所用的武器是RFB半自动战斗步枪，无托结构，弹匣在后。
一旦目标躲避，从这个角度再难取得成效。赤井秀一看穿了琴酒的企图，他没有浪费时间，转身上楼。既然琴酒想要在高度上取得优势，那么他就在高处等着他。
这是一场对等的战斗。双方使用的武器相似，人数相同，且身处陌生的环境。
当琴酒爬到楼顶，赤井秀一已经在对面架好步枪等他。想登上楼顶，唯一的通道就是那扇门。经过估算，子弹应该可以穿透铁门。只要有动静，赤井秀一会毫不犹豫地开枪。
铁门刚刚打开一条缝，三枚子弹分三个不同位置击穿铁门。就算没看到结果，赤井秀一也知道没有击中目标。
如果琴酒是这么容易就被干掉的，他也用不着卧底这么长时间。
前来支援的武装力量越来越多。他们接到的命令都是封锁周围地区，除非遭到攻击或接到新命令，否则不允许擅自加入战斗。
“长官，我觉得，我们可以去帮助他，为什么拒绝呢？”尼克问。
纪海宏微笑喝茶：“因为，这是属于他自己的战争。”
