伏特加死了，不是死于“机构”，而是死于自己人的手中。
在遭遇袭击时，别墅内的所有人立刻作鸟兽散。正在这个绝对隐蔽和安全的别墅内享受晚餐的组织干部们猝不及防。
琴酒事先观察过别墅结构，从敌人的火力上，他知道对方是有备而来。让部下分散撤离，化整为零，琴酒也按自己的路线撤退。
让所有人没想到的是，对方和想象的完全不一样。炮弹和真正意义上的武装直升机表明，他们并不是警察和公安，而是一支训练有素的军队。轰炸刚一结束，这些武装人员冲进别墅，几乎没有给人们留下任何反击的时间和机会。
基尔也没有傻愣着，她确定袭击者不是公安和CIA等情报部门，她也没有得到任何与攻击计划有关的东西。虽然怀疑毛利小五郎与此事有关，但也顾不得其他。
他们没有乘坐电梯下去。这种规模的攻击，明显表明对方不是一般势力，他们在海上肯定有部署。基安蒂和科恩决定从断崖附近索降下海。
贝尔摩德凭借高超的易容和隐蔽技术从敌方手中脱身，琴酒也有自己的办法。可是伏特加却没这么幸运，他没有来得及逃跑，和另一个组织干部被敌人围困。此时，意想不到的事情发生了。这个组织干部以伏特加为人质，企图让对方让步。
“机构”的行动目的就是抓获组织干部，一有机会，他们不会轻易开枪。伏特加也没有反抗，他知道，自己这边拖延一点，就会给大哥他们留出更多的时间。
劫持伏特加的组织干部代号为西拉，他要一辆车，准备劫持伏特加逃离包围。这时，“机构”下令，无论如何，也要抓到一个。
于是，武装人员向最有威胁性的西拉开枪。然而西拉为了求生，用伏特加替他挡了子弹。
西拉逃跑，而这一切，都被基尔看在眼里。
……
“机构”的行动是成功的，他们虽然没有抓到琴酒等人，但还是逮捕了很多高级别组织成员。从伏特加的尸体上，他们也找出很多想要的答案。
唯一美中不足的是，毛利特工的身份被发现了。
“机构”一直想弄清楚佩特的动机，他们不相信佩特的所谓“复仇”的鬼话。
这一切都和毛利小五郎无关，身为钥匙，他为“机构”打开了一扇大门，他的使命完成了。
小兰没有从柯南那里问出什么，这让她着实有些气恼。一向乖巧听话的柯南竟然在这件事上三缄其口。
而且当天，老爸不仅给她发信息说不在家吃饭，晚上还说因为业务的关系要在朋友家借住一宿。一老一少都不正常，这算什么嘛！
第二天，小兰在学校见到了园子。相比她，园子对昨天的事情好像更为坦然。
“我家大厦被炸之后，我也见到了不少奇怪的人，比如什么公安，好像是在拍电影，”园子说，“估计你家小鬼和纪海宏也遇到了什么事吧，那些人比我见过的任何保镖都专业。”
灰原昨天晚上倒是给小兰打了个电话，让她别把今天这事儿放在心上。她不说还好，一说，小兰更加郁闷了。
什么天大的事情，连小孩子都知道，她这个当姐姐的居然不知道？
“嗨！兰桑！园子！”
“哟，是世良酱呀，昨天晚上休息的可好？”园子打趣道。
世良说：“哼哼~我不仅休息的好，还知道兰桑昨晚肯定和柯南君发生了不愉快的事情。”
小兰目瞪口呆，随后问：“世良酱，你是不是也知道什么？”
“我——知道一部分，但是柯南君知道的更多，他很快就会告诉你的。”
世良灿烂的笑容让小兰提不起追问的念头，这个问题萦绕在她的心尖，一直到放学。
放学后，校门口好像有些骚动。小兰走出校门，看到一辆身姿优美的蓝色超级跑车停止路边。一位打扮奢华的男子立在车前，头上戴着一顶亚麻帽。
这人看到小兰，向她走来。小兰很是奇怪，她下意识认为这个人很眼熟，可是她不能确定对方是谁——直到男子走到她面前。
“爸爸？你——这是！”当看清男子的真面目，小兰大吃一惊。
妃英理出现在毛利小五郎的身后：“兰，我知道你有很多疑问，有什么事情，上车再说吧。”
来到东京最豪华的餐厅，毛利小五郎轻车熟路的安排好一切。在餐桌前，小兰终于知道父亲的另一种身份。
毛利小五郎所在的“机构”是政府特别设立的部门，级别比公安还要高，是“秘密部门中的秘密部门”。十年前，为了应对一起危害国家安全的突发事件，“机构”急需一名可以担当关键角色的新面孔。恰好，正在警视厅任职的毛利小五郎引起了他们的注意。
这还要从犯人在警视厅脱逃，挟持妃英理的事情说起。毛利小五郎的处置手段在整个东京引起轩然大波，但“机构”认为，这种看似极端又合理的处置手段，非常人可以做到。
于是，“机构”联络到他，劝其自动离职，加入“机构”，为国效力。
经过一番考虑，毛利小五郎最终同意。他知道加入“机构”，会获得比警察还要丰厚的待遇和报酬，同时，也会获得比警察危险百倍的威胁。为了家人的安全，他以“妻子不懂事”为借口与其分居。
原本，毛利小五郎想着，在解决这个突发危机之后，就重返警察岗位，与家人团聚。可是没想到，危机解决后，他亲自发现了新的黑幕。
无法脱身了。
“什么？”小兰表示难以置信，“妈妈你也就这么和爸爸分居了吗？你没有怀疑过什么？既然有危险，为什么妈妈又放心的把我放在爸爸身边呢？”
“因为保护一个人总比保护两个人容易，你的父亲已经不是从前的那个警察了，经过培训，他的能力飞速提升，可以说是日本版的詹姆斯邦德。”
除了惊异于父亲的变化，小兰更惊讶母亲的坦然。她非常委屈：“难道，你们分居十年，就是为了这种事吗！我什么都不知道……妈妈至少能猜到什么，可是我什么都不知道，我，我是你们的女儿呀，就算不能告诉我真相，为什么不编个更好的理由呢！”
父母最难回答的，是来自女儿的质问。毛利小五郎亏钱妻子和女儿的太多太多，为了自身的职责和使命，他不得不这样做。
他不担心小兰会埋怨他们，当她走入社会，自然会明白一些道理。
“亏欠你们母女的，我一定会补偿回来，看这里，兰，这里是东京最高档的餐厅，楼下的跑车，在东京都没有几辆，这就是我得到的回报，你看，现在我和你妈妈都在这里，还有什么比这更好的呢？”
妃英理用纸巾擦干女儿的眼泪。安慰道：“乖女儿，其实这件事，和工藤新一也有很大的关系。”
“啊？为什么？”小兰懵懂的问。
“你不想想，为什么他经常离校办案，很长时间都不见踪影？去问问柯南吧，他知道一切。”
……
与此同时，柯南在侦探事务所内坐立不安。大叔向他说明情况，并下达最后通牒，在今晚必须向小兰坦白一切。
什么鬼，原来大叔才是最后BOSS？而且这也太快了吧，他还没有心理准备！
“买个钻戒，趁热打铁，把婚求了得了。”电话中，纪海宏这样讲。
柯南紧张的想要骂人：“凭什么！不，我是说，为什么非要这样？”
“大侦探，你隐瞒了她这么久不说，还经常和小兰姐姐一起洗澡，光这条罪名就够你死千万次了，如果不下血本来转移话题，现在一件棺材的价格也能抵一枚钻戒，你是要翻盖的还是要滑盖的？”
“可可可可时间来不及的说！来不及！而且谁会卖给小学生钻戒呀！”
纪海宏沉默许久，惋惜的说：“那么问题又回到了原点——你的棺材是要翻盖的还是滑盖的？”
柯南绝望的挂断电话，他之前给纪海宏打电话，是为了排解心中的压力，顺便求解决之法。
而现在，他更想死了。
灰原对纪海宏说：“看样子，很多秘密已经无须隐瞒了，对吗？”
“对某些人来说，这样也不错，至少不用纠结欺骗和隐瞒的问题，这几天外面比较乱，除了上学，还是尽量少出门。”
伏特加的死亡消息在各情报机构内飞速传播，纪海宏和灰原也知道。很多人都认为，这是组织分崩离析的先兆。
纪海宏比较在意佩特的事情，他有理由背叛战神小队，却没理由背叛组织。佩特本身就是组织培养出来的，他和组织会有仇？别开玩笑了。除非有什么巨大的利益在背后鼓动，否则，佩特不会想当然的叛变。
到底是为了什么呢？
赤井秀一盯着电脑上的情报，轻轻摇晃杯中的加冰威士忌。
