郑芝龙，福建南安人。明末，入海寇颜思齐党为盗；后受抚，累官总兵。
本朝顺治二年，大军定江南，芝龙弟鸿逵为明福王朱由崧总兵守瓜州，兵败南还，与明阁部黄道周拥立唐王朱聿键于福建，封芝龙为南安伯，晋平国公。芝龙尝亡命日本，娶倭妇，生子森，以厚币迎归，引谒聿键，赐姓朱，改名成功，封忠孝伯。而芝龙以聿键立非己意，日与文臣忤。又以我招抚大学士洪承畴、御史黄熙允与同里，通音问，密谋归款。
三年，贝勒博洛师至福建，斩聿键，以书招芝龙降；芝龙喜，率所部降军门。时成功年二十三，阻之，不从，遁入海。
四年，博洛班师，以芝龙归，诏隶汉军正黄旗。芝龙子六：长即成功，先为南安生员，后冒称明裔；次世忠、世恩、世荫、世袭、世默。芝龙入京，惟世忠从。成功纠众得数千人，据南澳，遥奉明桂王由榔年号，自称招讨大将军。鸿逵据白沙，族人郑彩据厦门，郑联据梧州（按当作浯屿），互犄角，劫掠沿海郡县。
五年，叙芝龙投诚功，授三等子爵。是年，成功陷同安，进犯泉州，总督陈锦等以兵援，成功遁。
六年，由榔遣使封成功延平公。
七年，成功寇广东潮州，为总兵王邦俊击败，还自揭阳，袭夺彩军；联度不敌，亦避去。成功始据厦门、金门。
八年，巡抚张学圣侦成功复寇潮州，遣总兵马得功袭厦门，攫其赀；成功还，复连陷同安、漳浦、诏安、南靖、平和、海澄、长泰，进围漳州。
九年三月，锦赴援，战于江东桥，不利，退屯灌口，为家奴李忠刺死。十月，都统金砺援至，成功败遁海澄。先是，芝龙请留弟芝豹及子世恩守其祖栖庭、父士表墓，母妻妾及诸子随入京，并请改隶镶红旗汉军；诏允所请，仍官世忠为二等侍卫。至是上命芝龙书谕成功及鸿逵降，许赦罪授官，并听驻原地方防剿浙闽广东海寇，往来洋船令管理。
十年，诏封芝龙同安伯、成功海澄伯、鸿逵奉化伯，授芝豹左都督；使至闽，芝豹随母入京，成功不受封，掠如故。
十一年，寇漳州，千总刘国轩叛，献城。芝龙请令世忠偕使往抚，成功益骄，要地及饷，不薙发，书词悖慢。命世子济度为定远大将军赴闽防剿。是时成功分所部为七十二镇，伪设六官理事，假由榔号便宜封拜。
十二年正月，左都御史龚鼎孳疏劾芝龙蒙豢养者十年，弥桀骜，家仆往来海上，信息频通；子弄兵海壖，父高枕都下，酿祸之根请早除。而巡抚佟国器亦获芝龙与成功私书上之。诏革芝龙爵，下狱。八月，成功陷浙江舟山，闻大军南来，遁。十二月，芝龙仆尹大器首其父子交通状，敕芝龙自狱中以手书招成功，不降即夷三族。
十三年，严禁沿海奸民与贼贩米接济。初，成功令伪将苏茂寇揭阳，败归，恶而杀之。至是谋仍北犯，留其党黄梧守海澄；梧以茂见杀，惧及，斩伪总兵华栋以城降，诏即封梧为海澄公，驻漳州。梧乃悉发郑氏墓，斩成功所置五官商之为漳民害者。是冬，济度班师。成功陷闽安镇，犯福州，转掠浙江温、台等郡。
十四年二月，梧荐降将施琅同办贼。琅，晋江人，初为成功部将，后投诚，父及弟侄均被杀。梧知琅智勇，故荐之。于是擢琅副将。三月，梧具揭兵部，请速翦芝龙以绝盗根；诏流芝龙及其家属于宁古塔。梧等谓不杀芝龙，成功之心不死，海上诸伪将投诚之意不决；总督李率泰以闻，上嘉纳之。是年，鸿逵病死，成功陷台州。
十五年，陷温州，由榔遣使封成功延平王。
十六年五月，成功连艘北犯，踰崇明，陷镇江，顺流犯江宁。八月，舟至观音门，值贵州凯旋大军浮江下，败其前锋。成功率水陆贼数万围江宁，列巨舰，阻江南北要路。江苏巡抚蒋国柱、总兵梁化凤赴援夹攻，贼大败，阵斩伪总统余新，生擒伪提督甘辉等，俘斩甚众。余孽退犯崇明，游击刘国玉等复击败之，成功南遁。十月，命将军达素、总督李率泰分军，一出漳州、一出同安，捣厦门；寻以战舰未修，引还。
十七年，命靖南王耿继茂由广东移镇福建，都统宗室罗托为安南将军督剿。
十八年，谕迁濒海民入内界，增兵守边。成功既自江南败归，又接济路绝，由榔已走缅，少声援，势日蹙，乃觊取台湾以自保。台湾旧为荷兰国红毛番所有，芝龙与颜思齐等为盗时屯于此，后仍归荷兰。至是成功舟抵鹿耳门，阻风涛不得入，潮骤涨丈余，遂登岸。荷兰人拒之，成功绐曰：『此地我先人故物，珍宝听尔载归，地仍还我』。荷兰引去，成功入据之。其留守铜山伪都督万仪、万禄等赴梧军降。是冬，芝龙及子世恩、世荫、世默等俱伏诛。
康熙元年，潮洲总兵许龙擒成功从弟成赐于厦门。成功之入台湾也，长子锦留厦门，与乳媪通生子。成功怒，遣伪刑都事洪卯、礼都事黄副杀锦及锦母董氏，且遣伪总兵周全斌尽杀诸伪将留者。于是诸伪将拥立锦为平国公，以兵拒，杀卯、副，囚全斌。成功闻之，恚甚，发狂，啮指死。台湾诸伪将亦以成功弟世袭为招讨大将军，寻为锦所逼，奔泉州降，授左都督。继茂、率泰以成功既死，谕锦降，不从。会锦杀其从伯父郑泰于金门，泰弟伪同安伯鸣骏及泰子赓、伪永城伯缵绪均赴泉州降；鸣骏授遵义侯，缵绪慕恩伯，赓左都督；诸来归者各授爵。
二年六月，诏檄荷兰夹板船同剿厦门、金门两岛、于是继茂、率泰简投诚军及荷兰船出泉州、提督马得功出同安、梧及提督施琅出漳州。十月，大军屯厦门，贼溃。琅以水师同荷兰众进击，斩千余级，乘胜克金门及浯屿。锦与伪忠明伯周金斌宵遁；寻犯云霄镇，总兵王进功击破之。
三年正月，伪都督杜辉献南澳，授左都督；全斌亦降，授承恩伯。锦与伪永安侯黄廷等拥众保铜山。三月，继茂、率泰进攻，梧、琅先后以兵出八尺门，黄廷及伪将军翁求多等率众三万降，遂拔铜山焚之，获仗战舰无算。锦载其孥渡海入台湾，海上诸岛悉平。七月，上以琅谙海疆军务，特授靖海将军，以承恩伯周全斌及降将左都督杨富为副将，进剿台湾。荷兰复以夹板船至，约期攻澎湖；会阻风，不得进。
四年，廷议撤兵，琅乃还。率泰遣知府慕天颜赍诏至台湾谕降。锦请称臣入贡如朝鲜例，上弗许。嗣锦阴遣人往来岛上与沿海民互市，颇接济为奸利；琅密奏：『若恣锦生聚，是养廱也，宜速剿』。
六年，召琅来京，又陈台湾可取状；下部议，以风涛险，制胜难，必寝其事。
十三年，耿精忠叛应吴三桂，据福建，结锦为援。锦乃仍称由榔年号，纠众渡海而西，陷泉州。事闻，上谕总督郎廷佐以耿逆宜剿，海寇宜抚。会潮州总兵刘进忠叛降于锦，锦遂入潮州，执续顺公沈瑞及其孥。精忠复结锦围漳州，梧恚卒，子芳度婴城守，以计佯与锦和，拒精忠，命平南王尚可喜发兵援之。
十四年，芳度计泄，精忠围益急，总兵吴淑等叛献城，芳度督家丁巷战，力尽赴井死，全家遇害。
十五年，康亲王杰书奉命定福建，精忠降。锦遣伪总统许耀以贼二万犯福州，连营乌龙江；康亲王遣都统喇哈达等渡江奋击，克贼营，追奔四十里，进兵规复兴、泉、汀、漳四郡。
十六年，副都统穆赫林等克泰宁、建宁、宁化、长汀、清流、归化、连城、上杭、武平、永定十县，喇哈达等克泉州，斩许耀；锦弃泉州遁。
十七年春，康亲王遣知府张仲举招谕，锦不纳；其党复由海澄据玉洲等寨分犯石码、江东桥，漳、泉复告警。伪总督林英犯泉州，提督段应举击败之于日湖，生擒伪总兵林耀等。叛贼吴淑复由石码登岸，海澄公黄芳世同都统孟安击败之，沈其船。副将汪国祥亦败锦子克塽于庙岭。上以海寇盘踞厦门诸处，勾结山贼，煽惑地方，由濒海民为之接济，诏如顺治十八年例迁界守边。四月，穆赫林、黄芳世会师湾腰树御贼帅刘国轩，失利；贼遂陷平和、漳平及海澄，段应举、穆赫林与总兵黄蓝皆死之。国轩寻围泉州，命趋诸道军会剿。于是将军喇哈达、赖塔、总督姚启圣由安溪出同安，巡抚吴兴祚由仙游出永春，提督杨捷由兴化下惠安，总兵林贤、黄镐、林子威以舟师由闽出定海。八月，大军复平和、漳平、惠安，泉州围解；启圣同赖塔追国轩至长泰，大破之于蜈蚣山，斩四千余级。九月，复同安，斩伪副将林钦。十月，赖塔败贼于万松关；启圣、捷及副都统吉勒塔布等败国轩于江东桥，又败之潮沟；副都统瑚图败吴淑于石街，尽焚沉其船，贼党遁据厦门、金门。命厚集舟师取二岛。
十八年四月，以万正色为水师提督。国轩之遁也，启圣遣人入岛招之，弗从。启圣因疏言：『郑锦以台湾为穴，必不降，招抚无益。其伪武平侯刘国轩为贼渠魁，请赦罪，许授公爵；并赦伪将军吴淑罪，许授侯爵。若二人解体投诚，则锦势孤，海寇可立灭』。报闻。十月，副都统沃申败贼于东石，斩林英，擒伪总兵陈深。
十九年正月，正色请以水师攻海坛，而令兴祚赴同安与启圣、捷督陆路兵规取厦门。正色寻分前锋兵为六队，逼海坛，亲统巨舰继之，又以轻舟绕出左右并力攻，以巨炮击破贼船十六，溺死三千，余贼悉溃，伪将朱天贵遁据南日、湄州等澳。二月，正色追击至平海澳，与兴祚师会；天贵纠伪将军林升据崇武澳。正色乘风自平海南下，贼迎拒，掩击破之，斩伪总兵吴丙、伪副将林勋，湄州、南日、平海、崇武诸澳悉下，天贵降。沃申击贼将张志于大定、小定，连败之。我兵水陆进趋玉洲，国轩走厦门，伪总兵苏堪以海澄降。启圣亦分遣总兵赵得寿、黄大来随赖塔击陈洲、马州、湾腰山、观音山、展旗诸寨，兴祚复同喇哈达等由同安追剿至浔尾，遂克厦门、金门，余寇遁还台湾。八月，命于厦门、金门留兵镇守，康亲主还京。
二十年正月，启圣、兴祚疏请展界，俾沿海民复业；从之。是月，锦病死，伪侍卫冯锡范等以锦次子克塽为延平王，其长子克囗〈臧上土下〉被缢死。五月，上以台湾贼众内乱，仍命琅为水师提督，同启圣克期进剿。时续顺公沈瑞被絷在台湾，与伪行人傅为霖谋内应，事泄遇害。是冬，启圣与琅议师期，启圣欲用北风由围头进、琅欲用南风由铜山进，议不协。
二十一年，琅请简水师二万、战舰三百，独任讨贼。又言：『不破澎湖，台湾断无取理；臣请先取澎湖，督臣留厦门济饷』。允之。
二十二年春，国轩贻书启圣，请如琉球诸国例，称臣入贡。启圣以闻，上弗许，趣琅进兵。时国轩拥众二万余，据守澎湖甚坚。六月，琅军发铜山，入八罩屿，乘南潮攻澎湖，斩伪将军沈诚等七十余。复以大鸟船五十六，分八队奋击，沈其船二百，斩伪官三百余、兵万余；国轩乘小舟由吼门窜去，余众悉降。
七月，克塽遣伪官郑平英等乞降，琅请颁赦招抚。上赦谕郑克塽、刘国轩、冯锡范等曰：『帝王抚御寰区，仁覆无外，即海隅日出之邦，无不欲其咸登衽席，共乐升平。尔祖父自明季以来，出没海洋，盘踞岛屿。本朝定闽，尔祖郑成功窃据海隅，甘外王化，以及尔父郑锦勾引奸徒，窥伺内地，屡经剿抚，顽梗怙终。尔方童稚，妄思效尔前人窜伏台湾，恃为窟穴，倚险负固，飘突靡常，以至沿海居民，时遭兵燹。朕念中外兵民皆吾亦子，何忍听其久罹水火。故特命提督施琅选将练兵，出洋进剿。旋奏报澎湖已克，台湾指日荡平。总督姚启圣以尔等降疏奏闻，又据来使呈乞恩赦；朕体上天好生之德，特颁敕旨，前往开谕。尔等果能悔罪投诚，率所属伪官军民人等悉行登岸，将前罪尽行赦免，仍加恩安插，务令得所。尔等其审图顺逆，善计保全，以副朕宥罪施仁至意』。克塽既奉敕，遣伪官冯锡珪、刘国昌赍送降表。琅令侍卫吴启爵持榜示入台湾，谕军民薙发。八月，琅率大军入鹿耳门，至台湾。克塽及伪武平侯刘国轩、伪忠诚伯冯锡范率伪文武官迎降，收伪延平王金印一、招讨大将军金印一、公侯伯将军银印五。其地设府一，曰台湾；县三，曰台湾、凤山、诸罗。自郑氏据台湾二十余载，至是始入版图焉。是年克塽至京，授公爵，隶汉军正红旗。克塽死，爵除。
