癸酉，应天乡试，论题：《圣心如日明水清》。墨卷多用“青山绿水”等句，皆性理中语也。上阅之大骇，又御笔涂出文理纰缪者八卷，以礼部不行纠驳回奏，反行曲庇。尚书李康先闲住，主考庶子丁进降调，举人李愫、王佩等停革有差。
乌程倡“论行取知”推考选馆员。于是，徐开禧、胡守恒、张居、赖垓、林增志、王用子、梁兆阳、郭之祥、李仕淳、李景濂、鲁元宠、薛所蕴等十二人，考授编修、简讨等官。十二月十九日，始命下。又考选徐耀、范淑、秦之麒、宋学显、辜朝荐、叶向标、荆可栋、李汝璨、商用初等为给事中，邓钅弘、张肯堂、张缵鲁、刘呈瑞、张孙振等为御史。其改授者，张孙振拟兵部而上改御史，郑尔说拟御史而上改刑部。尔说，曾疏参温、王二辅者也。
崇德知县龚立本，考选授兵马。张孙振为归安知县，系乌程父母官，有奥授，因拉龚同营捷径。先是，龚梦有人言：“他日有张姓者，邀与同事，慎勿预！”至是，龚果辞，张遂由他途改换御史。
温体仁，乌程籍，归安人。王应熊，巴县人。同恶相济。吴宗达奉行两人意旨，毫无短长，时目为“篾片。”适礼部尚书黄士俊，丁未状元；左右侍郎孔贞运、陈子壮，己未榜眼、探花。京师为之语曰：“礼部重开天榜，状元、榜眼、探花，有些惶恐（黄孔）”；“内阁翻成妓馆，乌归、王巴、篾片，总是遭瘟（温）。”一时传以为笑。虽云出轻薄少年手，然赫赫师尹，而令人鄙夷至此，其生平可见矣。
是年正月，降贼王刚、王之臣等至太原挟赏，巡抚戴君恩诱刚等斩之。王之臣，即豹五也。而岢岚大盗高嘉计，号“险道神”者尤横。会山、陕大旱，饥民投贼者其众，南贼自郧阳薄谷城，掠新野、光化、襄阳。一时六路贼俱集，官兵大不能支。贼遂围均州，掠荆门景陵，陷房县及保康。
陕西贼陷恂阳，西乡士寇乘之，汉中震动，贼遂连陷紫阳、平利、白河，围兴安。兵备王在台固守，适洪承畴赴援，乃退，破凤县。
二月，特设五省总督，以延绥巡抚陈奇瑜为之。去岁廷议，流贼孔炽，拟特设总督，共推兵部侍郎汪庆伯。庆伯不欲往，乌程力庇之，遂止不设。至是始，用奇瑜受命，檄诸将会兵于陕州。贼在汉南者，为土人所拒，乃趋夔州，入四川矣。
上发帑金五万两，命御史梁炳赈济山西。山、陕自去秋八月至是不雨，大饥，人相食。永宁州民苏倚哥，至食其父母。
张应昌兵败于均州，贼还屯勋阳之黄龙滩，分三股：一趋雒阳，一趋浙川，一趋卢氏。时调宁远边兵剿贼，加副将张外嘉为总兵统之。行之中途，饷不时给，辽丁直哄至帐下，外嘉抚驭无术，遂遇害。辽丁结队，溃入流贼营中。
四川贼复入陕，陷两当、凤县，将由阳平关渡河趋巩昌。洪承畴追至成县，见贼势方盛，乃檄副总兵贺人龙、刘成功等统兵赴蓝田夹击。贼南奔汉中，承畴令断栈道，据守鸡头关，贼不得前，从间道犯城，固洋县官兵御却之。南犯川中，而川兵复扼守诸险，贼首李自成、张南忠等，坐困于汉中之车箱峡。会连雨二旬余，贼饥无所得食，贼马乏刍，死者过半，弓矢俱脱，指日束手就擒矣。李自成等大窘，乃求抚。密遣人贿奇瑜，每抚一名，纳银五十两，奇瑜利其贿许之。凡降贼三万四千有奇，勒令还乡，仍归原籍，檄诸军按甲无动。每百人以一安抚官押送，所过郡邑，为具糗粮传送之。既度栈道，出诸险口，至草凉楼地方。一夜，众贼尽缚诸安抚官，或杀，或割耳，或杖责，或缚而掷之道旁，攻掠宝鸡、麟游等处，始纵横不可制矣。
七月，陕西贼陷文县，官兵逐之，东走网峪川，遂陷同官，既而走凤翔，趋汧阳、陇州。初，贼之甫叛也，猝至凤翔西关口，称：“奉督抚檄安插城内。”守臣知其诈，给以门不敢启，须缒上城，先登三十六人，尽杀之。总督陈奇瑜因借为辞，劾地方官绅挠偾抚局，以激上怒。于是知县李嘉彦、绅衿孙鹏等，皆逮问下狱。
洪承畴知降贼复叛，统兵进剿，至岐山，贼众大至，承畴兵仅三千，张疑设伏，贼遂趋耀州。时汉中兵三千四百有奇，总兵左光先等将之；临巩兵三千五百，总兵孙显祖等将之；平凉兵二千，副总兵艾万年将之。止可城守。总兵张全昌等，统兵六千，专视贼所向以为援剿。是时，猖獗甚，烽火直彻于耀州、富平、三原、泾阳。叛兵杨国栋拥三千骑，披双铠，直抵西安城下乞抚。巡按范复粹不敢应，巡抚练国事在鄠县闻之，驰还，登南城，檄国栋至，语，一日未决。度不受抚，必西走周至，密檄沿途官兵饬备，更设伏于周至之夹水沟。时禾茂泥淖，骑不任驰，伏发，歼其半，一贼斩国栋以献，余入终南山。贼混世王等从凤翔东趋，欲犯西安。洪承畴一夜驰入西安，檄诸路兵赴西安合击之。贼至西安东境，官兵以力疲不能出，承畴恐贼东出潼关，先令张全昌、曹变蛟间道趋渭南遏其前，而自帅兵驻潼关红乡沟。贼至，游击李效祖、柏永镇力战，贼却不得入关，因登玉山。承畴驰赴蓝田，欲从山后间道剿之，贼惧，夜走商南。初，老回回等先据雒南山中，今又益以诸贼，共阻险自守。承畴帅诸将驻潼关大峪口，以防其出，仍饬备阌乡、灵宝等处。闰八月，关西贼陷陇州，屯城中浃月，参将贺入龙剿之，贼围之数重。十月，承畴遣左光先等援之，围始解，而西走之贼，陷灵台及崇信、白水，又至泾州。是时，北至庆阳，西至巩昌，西北至邠州、永寿，西南至周至、郿县，遍地皆贼众，殆二十余万。陈奇瑜至是始悔其见迟，分兵堵御，而力已不支矣。御史傅永疏言：“汉南降盗，陷城破邑，所在骚然，皆由陈奇瑜专主招抚，谓盗已革心，不许道途讯诘，故郡邑不敢问，开门揖盗，剿抚两妨，皆奇瑜之流毒也。”十月，上以秦贼猖獗，逮陕西巡抚练国事，以李乔代之。十一月，陈奇瑜削职听勘。时廷论俱罪奇瑜误国，应逮问正法。而乌程一力护持，仅遣戍。李自成于七月陷澄城，围郃阳。闻洪承畴至，解围去，转寇平凉、邠州。八月，陷咸宁，杀知县赵济昌。适承畴至，西走乾州。十月，左光先击自成于高陵、富平间，斩首四百余级。自成佯求抚于监军刘三顾、真宁知县王家永，遽出城招抚，失其印。三顾即登陴拒守，自成乃奔邠州。张献忠同自成隐澄城，转掠平凉。闰八月，自成先锋高杰降于副将贺人龙。
七月，郧阳抚治卢象升剿竹山、竹溪诸贼，连战，斩七百余级，复败之于峡石，堕崖及投水者又千余人。
十二月，进洪承畴兵部尚书，总督五省。先是，西宁兵变，兵备孔闻籍阖室自焚，承畴还师定乱，贼遂陷陇州、郃阳。西宁既定，承畴整师而东，贼悉众东奔，分道尽入河南，集汝、雒间，左良玉军渑池，总兵陈永福令邓囗〈王巳〉军南阳。
八年乙亥，正月，下吏部左侍郎张捷于狱。张捷自荐吕纯如之后，倚乌程为奥援，乞休疏凡三十二上，皆温旨不允。疏内唁唁狂吠，无复顾忌。最后奉旨：“张捷佐计在迩，着即出供职！”正拟于计典肆其凶锋，而适有御史刘宗祥之疏。先是，宗祥巡按四川，成都知县贺儒修者，张捷姻也，捷特作柬托宗祥，欲得卓异一举，华阳一调，末又有“忠言不入，朝事日非”等语。宗祥入川，儒修狼藉甚者，宗实不能讳，据实纠劾。有旨：“革职逮问。”捷大恨。时宗祥回道考核，捷一力把持，拟加重谴。宗祥具疏剖辨，以捷手书上闻。宗祥甫投疏还，过太常少卿祝世美告之故。世美力止以为不可，急趋会极门取索原疏，则已封进御前矣。次日，旨下：“张捷革职提问。”后都察院拟“宗祥降三级，调外任。”御笔批：“刘宗祥着回道管事。”
二月，流贼犯凤阳，焚毁皇陵。报至，传辍经筵。是日十二，正当开讲也。百官皆角素，九卿上慰安公疏。二十四日乙巳，上御布袍，慰祭太庙。二十六日丁未，廷遣驸马都尉王炳慰告皇陵，百官俱布服从事，下诏罪己，减膳撤乐。随命逮凤阳巡抚杨一鹏、巡按吴振缨下之狱。振缨者，乌程幕客也，在台中七年，规避不差。及甲戌，台中沸然，谓：“此番吴再规避，当上公疏以正台规。”振缨不得已，乃就差次应得贵州，胡平运应得凤阳。振缨挟以乌程之势，请以贵州易凤阳。盖凤、庐、淮、扬，素称膻地，又与浙江邻近。平运因压于乌程从之。至是，以陵寝失事，同一鹏被逮，一鹏正法，振撄以乌程力庇，仅从遣戍。然乌程为振缨祈哀大珰，屈膝者再，阁体皆扫地矣。
又杨一鹏者，筮仕成都府推官。游峨眉山，有狂僧踞佛座，睨杨而笑曰：“汝犹记下地时，行路远，啼哭数日夜，吾抚汝顶而止耶？”杨追忆儿时事，大惊异，曲致礼焉。因留同宿，耳语达旦，临别，嘱曰：“二十年后，当会汝于淮上！”及是，杨开府淮安。一日薄暮，有野僧击鼓，称蛾眉山万世尊寄书。发函，得绝句诗七首，急索寄书僧，已不知所往矣。未几，流贼犯凤阳，焚祖陵，杨坐失事论死，其诗始传于世。其诗云：“谪向人间仅一周，而今限满恐难留。清虚有约毋相负，好觅当年范蠡舟。”其二云：“业风吹破进贤冠，生死关头着脚难。六百年来今一遇，莫将大事等闲看。”其三云：“浪游生死岂男儿？教外真传别有师。富贵神仙君两得，尚牵缰锁恋狂痴。”其四云：“难将蟒玉拒无常，勋业终归土一方。欲问后来神妙处，碧天齐拥紫金光。”其五云：“颁来法旨不容违，仙律森严敢泄机！楚水吴山相共聚，与君同跨片霞飞。”末二首不传。万世尊，即前狂僧也。密语受记，杨之子稍向人吐露，杨闻而诃之。临刑，神气如常时，预知定数不可违也。事颇怪，并附记。
先臣上《皇陵震动疏》，略曰：
“顷者，流贼不靖，乃至侵犯皇陵，焚烧禋殿，则真古今未有之奇变，君辱臣死之秋也。顾不亟灭贼，无以泄神人之愤，而不追溯乱源，亦无以施勘定之功。天纵神明如皇上，励精求治如皇上，而纷纭恇扰，寇盗相寻，斯其说在易之蛊矣。蛊之败坏，必易世而后见，故文皆以‘干蛊’为辞，明前人养其疾，至后人始受之也。皇上御极于乾刚解纽、国步几危之日，一振振涤，日月重光，深得先甲之维新；而于后甲之丁宁，似稍略焉。盖戊、己之际，废籍诸臣，汇征连茹，而谋国罔效，边疆失事，以致圣衷怀疑，群邪伺隙，沿至于今，谬种渐芽，蔓延滋长。孤阳时翳于阴暧，砥柱莫挽于狂澜。魍魉或啸舞于离明，狐鼠且纵横于城社。逆气足以召逆，妖氛足以成妖。此致乱之源也。堂陛之地，欺猜愈深，朝野之间，刻削日甚。缙绅蹙靡骋之怀，士之嗟束湿之困。商旅咨叹，百工失业。本犹全盛之海宇，忽见无聊之景色。此又致乱之源也。边事既坏，修举无谋，兵不精而自增，饷随兵而日益，饷益则赋重，赋重则刑繁。复乘之以天灾，加之以饥馑，而守牧惕功令之严，畏参罚之峻，不得不举鸠形鹄面无食无衣之赤子而笞之禁之，使愁苦之气，上薄于天。皇上虽有恤民惠下之德意，而九重邃密，何由得闻？下民无知，直谓有司仇我虐我，今而后得反之也。此又致乱之源也。将无纪律，兵无行伍，淫污杀劫，惨不可言。尾贼而往，莫敢奋臂，所报之级，半是良民。民间遂有贼兵如梳，官兵如栉之谣，民安得不为盗？盗安得不日繁？此又致乱之源也。具此乱源，而当事诸臣，不能忧国奉公，反躬省己，加膝堕渊，总由恩怨，张罗布网，费尽机关。试观数年以来，所为整纲肃纪者何事？推贤用能者何人？安内攘外者何道？富国强兵者何策？即如流贼一事，飘忽已久。既失一夫当关之事，纵虎出林；复误各抚分镇之谋，教猱升木。今日庙社怨恫，幽明胥痛。国事至此，诸臣之肉，岂足食乎？凡食君之禄、担君之爵者，皆当伏铁钅质之诛，膺放流之典。固非角素盈朝可以塞责，慰安一疏可以毕事者也。在皇上宜赫然一怒，以安天下。发哀痛之诏，明罪己之怀，按失事之诛，正误国之罪，行抚绥之实，蠲民间之积逋，使岂第循良民得专意于牧明。徐议财源之濬，无徒竭泽之鱼！尽斥患得得患失之鄙夫，广集群策群力以定乱。蛊之象曰：‘振民育德。’盖‘振’，取荡涤之义，‘育’，为有补救之方。若复养痈不决，弛瑟不张。俞咈无闻，而但云有旨囗囗，方圮既极，而尚言戴罪立功，忽忽悠悠，将安底止哉！”
奉旨：“本内追溯乱源，亟图妙算，殊属剀切。并理财用人等事，该部悉心筹画，以备采择。”
三月，升卢象升兵部左侍郎，总督五省军务，赐尚方剑，统关辽兵，剿东南贼。洪承畴剿西北贼。升山东巡抚朱大典总督漕运，巡抚凤阳，同象升协剿。逮河南巡抚元默，以陈必谦代之。
复召大学士何如宠，坚以疾请，允之。东阁直房前第一间为首辅所居，若未正首辅之称者，虽次叙第一，不敢居也。桐城再召，疏辞不允，勉强就道。至临淮，复以病坚辞，始蒙谕允。乌程竭力邀首辅之称，不可得。端阳，阁臣例有赐馔，大珰传谕，口称首辅，乌程即开首辅之室居之。
七月二十六日，皇上辟门，遍召群臣，试以票拟。先臣以病不能出，倪庶子元璐无病而亦不出。三十日，旨下：吏部取姜逢元、陈子壮、先臣、张至发、蔡弈琛、张元佐、闵仲俨、马之骥、张居九人履历。次日，廷推林钅干、孙慎行、刘宗周三人。阁票：“再推几员来看！”越三日，御笔批：“兵部马上差人召来。”七月二十六日，奉旨：“文震孟、刘囗囗、张至发，俱升礼部左侍郎，兼东阁大学士，即行入阁，与首辅体仁等协同办事。”阁中初票礼部尚书，御笔批礼部左侍郎，真特达之知也。二十八日上辞疏，二十九日旨下。八月初二日复上辞疏，午上而旨未刻即下。次日，即宣圣谕：“尽撤各镇监视内官。”其有拱己以听之意。先臣欲坚以病辞，香山力止以为不可，遂于十三日面恩入阁办事。
罢各镇监视太监，谕曰：
“朕御极之初撤还内镇，举天下事悉以委之大小臣工。比者多营私图，罔恤民艰，廉谨者又迂疏无通论。己已之冬，京城被攻，宗社震惊，此士大夫负国家也。朕不得已，用成祖监理之例，分遣内臣监视，添设两部总理，虽一时权宜，亦欲诸臣省咎引罪。今经制粗定，兵饷稍清，诸臣应亦省改。其将总理监视等官，尽行撤回，以信朕之初心！张彝宪俟漕竣，即回监供职。惟关、宁密迩奴寇，高起潜着削去总监字样，督理如故。”
先臣供事日讲，上甚属意，宫中尝言：“文震孟到阁中到好，只是他还是板金绦。”时先臣官少詹，止四品也。乌程侦知之，年终，讲官应叙劳题升，先臣应升正詹，乌程寝阁不题；傅祭酒冠，应升正詹。仍升少詹，阻遏后进，亦已甚矣。六月至八月，乌程大病不能起，上乃点用乌程。使乌程不病，此举不可几也。
时圣恩深重，捐躯莫能图报。而尔时天下事实有不可为者：政府之事权日轻，貂珰之盘蹈已久，能尽削之以归中书乎？疆场之饬备无期，内地之流毒愈炽，谁为宗岳之先乎？真小人张弧以伺我隙，伪君子甘言以售其奸，能一一烛照之俾勿堕其网乎？虽欲佐圣天子以转移天下，将安从措手也？窃为先臣计，不若坚以病辞，使圣天子知能辞宰辅者，惟先臣一人耳。宋神宗论温公辞枢密曰：“若他人，虽迫之使去，亦不肯矣。”惜乎！香山诸公，见不及此也。
上为流寇事，于二十一日召阁臣及府部科道官平台对面，诸臣各有敷陈，先臣奏：
“今调官兵剿贼，本以为卫民也。乃官兵不能剿贼，反以殃民，以致民间有‘贼兵如梳，官兵如栉’之谣。今惟严申号令，凡兵丁扰害民者，必杀无赦；将官能钤束兵丁，秋毫无犯，监军御史，立刻奏闻，破格优擢。”
上曰：“卿说得是”。又召入门内，先臣奏：“民间团聚村堡，正‘人自为守，家自为战’之意。官兵不得以索粮为名，到处骚扰，以致流贼亦冒妆官兵，混入村堡。欲堵御之，则虞以杀伤官兵，致干法网；欲拱手听之，则子女玉帛，听其捆载而去。民害何由得除？寇氛何由得靖？臣意请天语申饬：今后凡官丁所过，地方官预备糗粮，勿得以恶草塞责，违者参处；兵丁亦不许入村堡，违者听民间堵御，将官不得故纵。”府中某有言此不可行者，先臣复相辨析。时跪奏良久，上曰：“先生起来。”称“先生”，亦异数也。
故事：新参入直后，以名帖同礼帖致意大珰，大珰亦以名帖、礼帖致意，此旧规也。先文肃由特简入政府，此例遂废。大珰曹化淳，系王安名下，素附正人，疑先文肃有意外之托。王安之侄中书某，转致同人，且盛称曹珰皈依先文肃之意。又云：“若循例往来外廷，惟所欲为，大珰无不奉命。”同人以告，先文肃坚持不可，曰：“极大珰之力，使我不为宰辅耳。不为补辅，于我何损？而名帖既入，此辱岂能洗耶？”同人乃止。曹珰久不见复，以为大耻，遂与乌程比面。呼吸相应。先文肃顿失圣眷，盖由于此。
乌程于内廷凡有执事人员，极小者，节中俱有礼相候；掌印及秉笔者，又不必言。先文肃乃孤行一意如此，欲久居揆席，得乎？
先文肃壬戌廷试，大珰王体仁以御批第一，持名帖报喜。旧例：以晚生帖复之。先文肃语其人曰：“我新进书生，不知回帖怎样写，今姑以原帖奉复。”盖甫进，即与内奄抗，姜桂之性，老而弥辣如此。
时杭州解到龙缎三万匹，内奄索贿不遂，驾言不中用，令票旨驳还。先文肃与乌程言：“龙缎虽云不堪御用，然以充赐赍杂赏，似亦无妨。况三万匹入京，不知费民财几十万？若行驳还，复造以进，民不堪命矣！明主可以情告，宜出一揭，为杭民请命，乞行暂收。以后不以不堪者塞责。”乌程不可，票旨尽数驳还。后徵之数年，始克补解。
总兵曹文诏以剿贼阵亡，奉有恤典。其子曹变蛟任副总兵，有谢恩疏，阁票者再四，仍发出改票。御笔将奉恤典月日，及上疏月日，各加一点，阁臣咸不解其故。后数日，乌程入直，反复良久，曰：“得之矣”。乃恤典之旨尚新，与谢恩疏日月不相应，盖变蛟托人在京干。当邀旨后，随即具疏，即汉昭察霍光之明也。乃票旨诘问其故，次日，即下。先文肃谓“乌程亦有小才”。谓此。
浙江提学佥事黎元宽以文体事褫革。元宽出揭，尽发乌程嘱托诸私事，谓执法不阿乌程修怨所致。御史姜思睿据揭具疏参论，给事中姜应甲助之。思睿疏有为代草者，事颇泄，乌程乃得预为地。上果主先入之言。欲加降处，屡发改票，先文肃与香山竭力调护得免。
九月，部推操江，正为太仆寺卿张元佐，光禄寺卿王道直陪。上召对于暖阁，元佐抄拾陈言。率尔殊甚；道直兢兢，言不能出口。上点用道直。后四年己卯，浙江巡按题涂必泓，云南巡按题王范，上亦召对。必泓条奏两浙利弊甚急，上改王范巡按浙江，必泓巡按云南。盖圣意用人不测如此。
十月，上以流贼未平，震惊陵寝，特颁圣谕，避正殿，撤乐减膳，以初三日始居武英殿，百官俱宿公署，阁臣俱宿于朝房，诏曰：
“朕以凉德，缵承大统，不期倚任非人，边虏三入，流寇七年，师徒暴露，黎庶颠连。国帑匮绌而徵调未己，闾阎凋敝而加派难停。中夜思维，不胜愧愤。今年正月，流氛震惊皇陵，祖恫民仇，罪实在朕。今调边兵，留新饷，立救元元，务在此举！惟是行间文武吏士，劳苦饥寒，深切朕念。念其风餐露宿，朕不敢独卧重帏；念其饮水食粗，朕不敢独享甘旨；念其披坚冒险，朕不敢独衣文绣。兹择十月三日，避居武英殿，减膳撤乐。非典礼事，惟以青衣从事。与我行间文武吏士，共甘苦之，以寇平之日为止，文武官其各省过淬厉，用回天心，以救民命！”
七日，上御笔起用黄道周。十日，上御笔放王应熊。此两日，乌程皆以待罪不入直。而十日，嘉善、香山，皆以暂假不入，惟先文肃与辎川司票拟。说者谓巴县之放，先文肃实为之，由是忌者益耽耽不能旦夕容矣。
给事中许誉卿削籍为民，福建右布政申绍芳革职法司提问。誉卿由壬戌考选，历任工科都给事中，计今十四年，资俸俱极深。以母老，欲得南京太常少卿，以便迎养。同人俱不可，德州遂欲题升南缺。先文肃愠甚，语侵德州过当，德州怀恨。适台省同时攻德州及总宪，许公谓必须舍德州而专攻总宪。盖总宪与乌程朋比肆恶，尤不可缓。户科姚思孝业具弹章，以德州、总宪并列。以许公言，遂去德州，德州稍稍相忌矣。而御史张缵曾不通商榷，特疏独参德州，张寓与许比邻，德州疑此疏出先文肃及许公意。又山东左布政劳永嘉辇金六万两，主兵科宋之普家，营升登莱巡抚，已入启事矣。劳，故‘三案’漏网，诸台省拟合力以攻之。德州三过户科宋学显，曲致殷勤，求诸君稍徐之，候旨下而攻之未晚。盖旨既下，则前金可分享也。又曰：劳公之座，即申公之座也。申系寒家姻戚，时以右布政赍表入都，瓜期已及，盖直以此相期，而台省竟不能待，交章连牍。有旨：“登抚者另推！”而东省诸人，又无不怀恨矣。宋之普力怂德州，谓先文肃决不相容，自时以铨席待南冢及大司农，岂能久留汝耶？德州已心动，适又值张缵曾之疏，以之普语为信然。遂具疏参誉卿与绍芳，坐以“争官讲缺，”而参绍芳中有“凭藉奥援”等语，阁中相顾错愕。嘉善谓“争官须有实迹，当令回奏！”不应。乌程票旨，而悍然抢去，票旨云：“大干法纪，著降级调用。”夫既云“大干法纪”矣，而仅仅降调乎？次日，果改票：“著削籍为民。”先文肃力争之，不能得，乃言：“科道为民，极荣之事，敬谢老先生玉成之。”又二日，旨下：“誉卿为民，绍芳提问。”
十一月，大学士何吾驺与先臣同罢。许给事誉卿，复有去国一疏参乌程。乌程辨疏，即参先文肃，即指前“为民极荣”之语。谓：“皇上所以鼓励天下者，止有此爵禄位号，而文某乃云云，以股肱心膂之臣，为此悖伦灭法之语。”曰“悖”曰“灭，”盖深以激圣怒也。上览之果怒，有旨：“吾驺、震孟，不宜徇私挠乱。”疏未及吾驺，而旨突及之，知乌程所以相中者，非一朝一夕之故矣。吾驺与先臣，俱具疏引罪。再疏，吾驺奉旨：“着致仕去。”先臣奉旨：“着冠带闲住去。”
下庶吉士郑曼阝于锦衣狱。曼阝为壬戌庶吉士，建言蒙谴，林居亦十四年矣，与嘉善皆出华亭之门，称先后同门。郑之得馆选也，宜兴口诛笔伐，不少宽假，郑心怒之。辛、壬之际，攻击宜兴、乌程者甚众，郑因昌言：“宜兴决不可留，而乌程实可大用，言路不当并攻。”嘉善心善其说。既入政府，即力誉郑于乌程，乌程唯唯。嘉善邮寄郑书，谓：“当急来，吉致子情于乌程矣！郑复寄讯先文肃，先文肃力阻其来，郑反有愠心，以文肃之相为，不如嘉善也。至是，赴京补官，嘉善复言于乌程，谓：“某已来，是人可备先先生药笼中物，当以馆职畀之！”乌程复唯唯。武进旧辅，郑族母舅也，力毁郑于乌程，乌程信之。适时乌程新逐香山与先文肃，长安哄然不平其事，郑亦随众持愤激之论。乌程侦知之，谓郑特假语以欺嘉善耳，遂具疏纠郑。疏成，语嘉善曰：“今为郑某事具疏，当与老先生同题。”嘉善欣然。乃取视，则纠其杖母事。嘉善面赤股栗，不能出一词。乌程冷笑曰：“固知老先生不愿预也。”遂独具名以进。上方欲以孝弟风励天下，览疏震怒，下曼阝于锦衣狱。杖母者，郑为孝廉时，父振先私宠一婢，为嫡吴氏所虐。振先与子谋，假乩仙以怵之，吴氏惧甚，愿受杖以赎罪。即令此婢行杖，得次，曼阝不禁失笑。吴氏大怒，谓渠父子私构此局，遍诉三党，由是喧传有杖母之事。然其事已三十年，不可得而究竟也。
十二月，在籍礼部左侍郎林钅干、顺天府尹刘宗周，行取到京。有旨：“林钅干着以原官兼东阁大学士，入阁办事。刘宗周升补工部右侍郎。”
是年二月，流贼犯凤阳。先是，总兵尤世威等，统兵扼守潼关诸隘口，露宿凡十旬，皆患疫疠不能军。闻贼大至，遂溃。贼乃越卢氏，超永宁，转陷荥阳，攻汜水，屠之。又破固始，复分为三路：一趋凤阳，一趋六合，一趋颖、毫。颍州知州尹梦鳌、判官赵士宏率士民固守，城破，俱阖家殉难。遂犯凤阳，凤阳无城郭，贼至，官军无一人敢迎敌者，贼焚皇陵，楼殿俱烬，燔松柏三万余株，杀守陵内奄六十人，纵放高墙罪宗百余人。留守朱国率家丁巷战，斩贼二十七人，力竭以死。贼首扫地王、太平王入府治，知府颜容暄囚服匿狱中，贼纵囚，获之，贼首张盖鼓吹，杖容暄于堂下，杀之。推官万文等六人、武弁四十六人，俱被杀。十民被杀者数万，剖孕妇以视男女，注婴儿于槊，观其宛转呼号以为乐，焚公私邸舍三千余间，光烛百里，恣掠三日。太监卢九德、总兵杨御藩统京营兵至，南京兵京至，贼乃拔营趋庐州，沿途杀掠无孑遗。陷巢县，杀知县严觉。攻舒城，知县章可试塞三门。止开一门以诱贼，暗设坑以陷之，贼入死者千余人。援兵亦渐相逼，贼遂掠霍山，抵庐江，庐江敛金求免，贼伪许之，乘不意，夜袭城，城陷，复陷无为州。
贼首满天星、张大受等攻桐城，乘舆绕城呼降。守将射中其腰，遂趋潜大诸县，山民皆习猎，以毒注矢，人辄毙，所在结寨杀贼，贼遂走麻城。
三月，江北贼掠安庆，陷潜山，应天巡抚张国维率兵御之。江南兵素不习训练，猝与贼遇，陆营守备周礻右望风先逃，总练指挥包文达阵亡，全军溃散，贼遂入湖广，陷麻城及罗田。
蕲黄民擒获贼首爬天王，身长八尺，日啖人心数十，双目与发肉俱赤，自言：“此天亡我，非我过也。”倡乱九年，陷州县十余，所向无敌。今乃为村民所擒，岂非天哉？解至军门伏诛。
总兵邓囗〈王巳〉，为叛兵杀于樊城。囗〈王巳〉素无纪律，所将川兵，淫掠尤甚。俄骑营叛，囗〈王巳〉登楼以避之。见势逼，赵火死。举营北窜，惟步失未动。洪承畴令参将贾继选、周继元分统之。
五月，汉南贼陷宁羌，曹文诏进剿，夜至王峪，贼伏险以待，文诏击之，败。张全昌自咸阳出兴平之东，贺人龙入子午谷断其南奔，刘成功同游击王永祥驻金牙关遏其北走。贼夜渡河，趋郿县。承畴亦渡河追之，至王渠镇，贼力出恣掠，贺人龙击败之，追至大泥峪。贼舍骑登山，张全昌复击之，贼尽入终南山。
六月，陇西贼摇天动等袭陷西和，曹文诏赴援，文诏至婆罗寨，大军在后，而贼十余万骤至，力竭自刎。文诏敢战能杀贼，为贼所畏。报至，官军为之夺气。
陕西巡抚李乔革职议罪，甘学阔代之。
七月，贼高迎祥、张献忠等陷澄城。八月，陷咸阳。先是，贼翻川鹞降于承畴，贼首高迎祥屯乾州。承畴令翻山鹞说之，不听，南走武功，承畴追击，败之。迎祥率大队自武功、周至，分道渡河。十月，张献忠、老犭回犭回突出潼关，守将艾万年等兵溃，遂犯南邓，而一字王等部众十余万，高迎祥统十二万，亦自潼关出犯阌乡、灵宝。大队东行，尘埃涨天，阔四十里，络绎百里，老弱居中，精骑居外。总兵祖宽、左良玉，两军相对，遥望不敢邀击，贼遂屯于陕州。十一月，祖宽破贼整齐王于九蒿，贼溃而为二，东走偃、巩，南走汝、郏。丙辰，群贼大合于龙门白沙，连营六十余里。祖宽分兵袭击张献忠于姑家庙，大败之，斩首行余级，献忠遂陷巢县、含山，又陷和州，沿江下犯江浦。
十二月，贼高迎祥、罗汝才破光州，官吏士民，屠戮无遗。参将罗于萃击贼汉南，追贼至子午谷，又败之，贼奔饶风关。
