——1793年6月2日到1794年4月
在维护人道主张温和的人们死去后，再没有人主张在革命的胜利者中间建立和平、对战败者施以宽宥，再听不到反对恐怖独裁的声音。恐怖独裁笼罩着全国，吉伦特派和丹东派都曾试图防止这种暴力制度，但他们都死了。
各郡的暴动
虽遭到严重打击，但是吉伦特派并不甘心失败，5月31日成为各郡进行反对山岳党和公社暴动的导火线，这也是吉伦特派最后的一次尝试，但不幸的是，他们这次依旧因意见分歧而归于失败。即使吉伦特派团结一致也未必能获胜，即使获胜也未必能拯救革命。用公正的法律手段无法做到山岳党用暴力手段所做的事，缺少狂热他们如何战胜外敌，除了恐怖手段还有什么能压服各党派，不制定最高限价法怎样来满足群众的供应，不进行征用怎能保障军粮充裕？
在当时的情况下，吉伦特派本应团结起来共同奋战，但事实却恰好相反，6月2日后，吉伦特派里属于温和派的韦尼奥、让索内、迪科、丰弗雷德等人都被囚禁，其余的如佩蒂翁、巴巴卢、加代、卢韦、比佐和朗热内等人则四散逃亡。这些人首先逃到厄尔郡的埃夫勒，又转到卡尔瓦多郡的冈城，并且将这个地方变成暴乱中心。暴动者以在冈城召开的郡议会的名义，组建了一支军队，由温普芬将军担任统帅，并且对国民公会的专员、山岳党人罗默和马恩郡的普里厄实施逮捕，做好了进军巴黎的一切准备。
勇敢美丽的少女夏洛特·科黛认为献身于共和国就能拯救共和国，于是准备刺杀5月31日和6月2日事变的元凶马拉。但她不明白，暴政并非系于一人，而是系于一个党派以及共和国的暴乱形势。夏洛特·科黛实现了她壮怀激烈却于事无补的计划，然后带着纯朴的英勇气概和舍生取义的精神面对死亡。但遇刺而亡的马拉却因此比生前更受群众爱戴，人们在公共场所呼唤他的名字，民众团体的场所都安放了马拉的半身像，迫于形势，国民公会给予他进入先贤祠的荣誉。
与此同时，马赛和波尔多出现了武装叛乱，里昂也发生暴动，并得到了六十多个郡的响应。不久，各党派爆发了普遍的暴乱，吉伦特派当初开始行动的一些据点被保王党占据。保王党希望能领导里昂的暴动，将里昂变为在南方的暴动中心。这个城市非常留恋旧秩序，这里的丝绸厂、金银刺绣厂、奢侈品贸易等都依附于上层阶级。因此在一开始它就反对这种打乱旧关系、贬低贵族和僧侣地位、破坏工厂的社会变革。在1790年制宪议会时期，逃亡的亲王聚集在里昂附近的都灵，当时里昂在神父和贵族的领导下曾试图发动暴乱，虽然没有成功，但是暴乱的思想却保存下来。和其他地方一样，里昂在8月10日后就准备发动群众革命，并建立群众政府。当时里昂的领导者夏利埃，是马拉的狂热追随者。经历了9月大屠杀和1月21日事变后，他的胆量更大了。
当时，共和派的低级阶层在市政府拥有权力，保王党的中等阶级在各区占优势，二者之间尚未发生任何有决定意义的事件。到5月末，他们之间的争论开始趋于激烈，在战斗中各区取得了胜利，市政府则被包围和攻破，夏利埃逃跑后被抓住并处死。还受国民公会节制的各区义勇队，在国民公会面前辩解，说自己是受到雅各宾派和市政官的胁迫才作战的，国民公会对此没有理会。
6月事件不久爆发，在卡尔瓦多斯郡暴动的鼓舞下，里昂人举起了反叛的旗帜，全城设防，构筑工事，收留逃亡分子，组建了一支两万人的军队，由保王党的普雷西和维里欧侯爵指挥，并和撒丁国王一同策划军事行动。当时整个西部在动荡，对国民公会来说，以南方的武装叛乱为后盾的里昂暴动就更为可虑。保王党开始行动，各区联合起来宣布革命法庭的成员不受法律保护，并且募集了一万人的军队准备进攻巴黎。马赛的保王党也在伺机恢复活动，他们以共和派的面貌行动，最后才冠以自己的名义行动。在各区被保王党控制后，形势开始向着有利于反革命的方向发展。
对于这次暴动的新的变化，感到绝望的雷柏基在马赛港跳海自杀。自从皮塞侯爵率领着少数军队混入吉伦特派后，卡尔瓦多斯郡的暴动也发生了变化，有了保王的性质。当时，波尔多、南特、布勒斯特、里昂等几个城市公开表示同情6月2日被处死的人，但并没有多大帮助，因为这些城市都被雅各宾派控制，或者忙于和西部的保王党作战。
保王党借各郡的普遍暴动扩展了军事行动，初步获胜的旺代军占领了布雷絮尔、阿让通、土阿尔，在控制本境后又试图占据边境关隘，打开与法国以及英国联系的道路。6月6日，卡特利诺、莱斯居尔、斯托夫莱、拉罗什雅克兰指挥着由四万人组成的旺代军向索谬尔进发，攻下该城后又进军南特，以便稳固地保有旺代郡，并控制卢瓦尔河。卡特利诺率领旺代军继续进占翁热，渡过卢瓦尔河后佯攻图尔和勒芒，实际上却带领军队从右岸配合左岸的夏雷特同时向南特进攻。
似乎一切都联合起来进攻国民公会，在诺尔郡和比利牛斯山地区，国民公会的军队节节失利，中部有里昂军的威胁，南部受到马赛军压迫，西部则遭到了吉伦特派和旺代军的进逼，此外，两万皮埃蒙特军也侵入了法国。在阿尔贡纳和比利时战役胜利后，因为迪穆里埃与雅各宾派的摩擦，军队与政府不和，尤其是这位总司令叛变后，武力反抗的情况更为严重。军事行动不再统一，军队也失去了高昂的士气，内讧不休的国民公会与失意的将军们之间也不再互相信任。
法马尔军营接管了迪穆里埃的残部，由当皮埃尔指挥，但战败后他们被迫退到布陕城下，当皮埃尔阵亡。从敦刻尔克到吉维这一段的边境也遭到了优势军队的威胁，虽然将居斯蒂纳从摩泽尔河调到了北路军，但也未能挽回颓势。法国的门户瓦郎西安失陷，军队连续失利，退到了斯卡尔普河南岸的阿腊斯，这里是巴黎的最后一个退守阵地。因为敌人的进攻和粮食短缺，加上摩泽尔河方面军被压缩而无法增援，美因兹方面投降了。英国政府认识到凭借饥馑就可以使巴黎和各郡陷于绝境，于是封锁了法国的所有港口，并没收了向法国运送粮食的中立国船只。这种旨在饿死全法国人民的新手段，迫使法国在三个月后不得不制定最高限价法，共和国的情况已经坏到了无以复加的地步。
全民皆兵全国备战
濒临解体的国民公会根本没有能力应付这种情况，斗争刚刚结束，胜利的一方还没来得及建立新政府。在各郡和边境的处境没有这么危急之前，山岳党曾召集各地的特派代表，开始制定人们期望已久的宪法。吉伦特派希望宪法能够在1月21日以前颁布，用法治来代替革命政体，不但以此来拯救路易十六，同时也为了预防自己遭到放逐。在5月31日以前，吉伦特派再次提出这个问题。但山岳党人先是审判路易十六，后是排斥吉伦特派，通过这两次政变使国民公会避开这个问题的讨论。如今，成为统治者的山岳党则急于颁布宪法，以便拉拢共和派，罗埃·德·塞舍尔则是山岳党的立法者。几天之内，国民公会便通过新宪法，并提交初级议会同意。
无论是在讨论宪法期间，还是在宪法提交初级议会之后，山岳党一直明白自己面对的威胁和危险。在国内，他们要镇压三四个党派，并消除性质不同的内战，以此挽回军事的失败，对外则要抗击反法联军，但勇敢的山岳党人在危急处境下并未惊慌失措。前来迎接宪法的四万四千个公社代表在国民公会前被接见，大家一致表示同意宪法，并且提出要逮捕一切嫌疑分子，实行全民皆兵。
丹东同意了人们的要求，发表演讲说：“我们同意初级议会的代表们提出的实施战时紧急政策建议。国民公会现拥有了全国的力量，更应该维护自己的尊严，我要求国民公会立即颁布法令，赐予初级议会权力，让代表在全国征集武器、粮食和军需品，发动群众的力量，组建四十万人的军队。用我们的大炮来向敌人宣布我们的宪法！并且我们要进行庄严的宣誓：每一个人都要誓死消灭一切暴君！”然后，所有在场的代表和公民都宣了誓。
此时，由革命派组成的救国委员会成为各项活动的中心和国民公会的政权机构，几天后，巴雷尔以救国委员会的名义宣布要采取更全面的措施：“目前自由是所有公民的追求，因此，有人为此应贡献聪明才智，有人应为它归还财产，或者提出建议，或者出力流血。总之，无论男女老幼，每一个法国人都要响应祖国的号召，保卫我们的自由。所有的物质和精神，无论是政治手段还是经济手段，都应该为自由服务。所有的一切都是为了满足自由事业的需要，在即将来临的全国性行动和军事行动中，我希望每个公民都能坚守自己的岗位。年轻人能驰骋疆场，男子负责制造武器、运送弹药、筹备军粮；妇女则负责缝制军服和帐篷、看护伤员；儿童可以帮助改制绷带，老人负责宣传对国王们的痛恨和对共和国的一致拥护，鼓舞战士们的勇气。公共房屋改为军营，公共场地临时变作工厂，征用民间的马匹，群众手里的猎枪、刀剑及长矛都要变为武器。我们的共和国如今就是一个被包围的大城市，而整个法国就是一个巨大的军营。”
这些措施立即被宣布实施，凡年满十八至二十五岁的法国人都作为新兵去补充军队，所有征来的粮食都要供应军用。一时间，共和国拥有了十四个军，一百二十万士兵。对共和派而言，法国成为了一座军营和一个工厂，对反对派却是一座监狱。共和国在进攻公开的敌人的同时，还要消灭隐藏的敌人，于是颁布可怕的惩治嫌疑犯条例来针对国内的反对派。首先采取的是预防措施，图谋不轨的外侨遭到逮捕，君主立宪派和温和共和派被羁押，这些人在和平实现以前将被管制。5月31日后形势更加严峻，资产阶级、商人、中产者如同8月10日之后的贵族和僧侣阶级，成为罪犯的主要构成者。
此外，为了满足对内的需要，建立了一支由六千士兵和一千炮手组成的革命军队，为了确保革命者能保持纯正思想，发放了爱国公民证。俱乐部负责监督各级官员，每个区都成立革命委员会，从全方位对付国外敌人和国内叛乱分子。
山岳党人的胜利
在经历了韦尔农的初次交锋后，叛军立即溃散。温普芬纠集残部，企图卷土重来却未能得逞。从前极力维护吉伦特派的温和派阶层，变得软弱无力毫无斗志，在其他郡赞同宪法之后，这个阶层也借此机会承认错误，并在叛乱中心的冈城举行了忏悔仪式。
与此同时，卡尔托将军率领部队两次击败了南部的叛军，追赶他们到马赛，并乘势进占了马赛。失败后的保王党逃到土伦向英人乞援，并且将法国的这个重镇交给英国人，普罗旺斯才没有被制服。英国的胡德海军上将进入土伦后宣布路易十七为法国国王，从海道运来八千名西班牙军队，解除法国舰队的武装，并占领了附近要塞，向土伦进军的卡尔托被迫退回马赛。尽管遭遇了这次挫折，国民公会的军队仍然保持优势。根据山岳党专员的命令，他们进攻了叛乱的各重要城市，冈城被罗贝尔·兰代占领，波尔多被塔利安攻下，巴拉斯和弗雷隆则进入马赛。剩下的只有土伦和里昂未被攻克，南部、西部和中部的联合与进犯已构不成威胁，国内的敌人只处在守势。
克勒曼率领阿尔卑斯方面军包围了里昂，三个军团从四面围住这个城市，阿尔卑斯的老兵、革命的营队、新入伍的军队每天都在增援。起初，里昂叛军拼命抵抗，但南部的叛军已被卡尔托击退，无法提供援助。试图为里昂叛军举行牵制攻击的皮埃蒙特军，也被克勒曼所击败，里昂叛军失去前沿阵地后，又面临绝粮、士兵缺少斗志的困境。保王党的首领们意识到负隅顽抗无济于事，于是弃城而走。共和军顺利攻克里昂，在那里等待国民公会的命令。几个月后，击败里昂叛军的部队前去增援意大利方面军，在经过反复攻击和英勇机智的军事行动后，有精兵固守和坚强防御工事的土伦终于被攻下，落入共和军的掌握，结束了以攻占里昂开始的战役。
在进攻南特的战斗中，旺代叛军损失重大，统领卡特利诺战死，这次失败宣告旺代叛乱和外侵行动的终结。保王党放弃索谬尔，再次渡过卢瓦尔河退回原地，但他们的力量仍然强大，共和军追击到旺代境内后又被打败。比隆接替贝律耶将军，在极其不利的条件下率领少量兵力继续作战，但比隆的进攻方法不当，因此改任坎克洛和罗西尼奥尔为指挥，但情况依旧没有好转。坎克洛与罗西尼奥尔的意见存在分歧，山岳党温和派的专员菲利波与救国委员会的专员布尔勃特也无法通力合作，由于步调不一致，行动不统一，这次进攻又以失败告终。
