二、在自然界存在和发展规律上的自然哲学思想
回族学者有多方面的知识，天文学、数学、医学等知识更为丰富，这方面有很多的著作。正是在丰富的自然科学的基础上，他们探讨了自然界存在和发展的规律，打下了自然哲学思想的科学基础。但是，我们不能不看到，回族的自然哲学思想是从伊斯兰教的观点出发的，它一方面探讨了自然界生存发展的基本规律，另一方面在万物本原问题上，又必然认为真主安拉是最后的创造主。马哈麻在《回回天文书》“序”中指出：“天理无象，其生人也恩厚无穷，人之感恩而报天也。心亦网极，然而大道在天地间，茫昧无间，必有聪明睿智圣人者出，心得神会斯道之妙，立教于当世，后之贤者接踵相承，又得上古圣人所传之妙，以垂教于来世也。圣人穆罕默德及后贤辈出，有功于大道者昭然可考。逮阔识牙耳大贤者生，阐扬至理，作为此书，极其精妙。后人恪守尊崇，纵有明智，不能加规而过矩也。”在这个序中所说“大道”，是指自然界的生存发展有其基本规律，但又认为“大道在天地间，茫昧无间，必有聪明睿智圣人者出，心得神会斯道之妙”。从这里可以看出，回族的自然哲学思想有历史功绩，承认“大道”存在于天地之间，是一个永恒向前发展的不可分割的统一的整体，其生存和发展具有客观必然性，有它的内在规律。这本来是十分有价值的思想，但又认为，“大道”和天地万物一样，“皆真宰之所生化之也”（刘智语）。在这个“序”里，还有一个很重要的思想，就是人们可以认识“大道”的奥妙，发挥人的主观能动作用，掌握自然界的客观规律。当然，认识和掌握自然规律，是在充分肯定真主安拉地位的前提下进行的，回族学者的观点不可能离开伊斯兰教的基本教义。
回族自然哲学思想是建构在自然科学的发展基础之上的，特别是天文学的重大成就，使回族学者在自然哲学观上能够对“大道”的奥妙加以探讨，使回族自然哲学思想不断得以发展。回族天文事业的发展，在中国的科学事业发展中占有一定的地位，作出了很多的贡献，受到统治阶级的高度重视。回族天文理论不仅为中国天文学的发展提供了一个参照系，而且也是构成自然哲学思想的载体，对于“大道”的阐述和研究正是通过天文观察宇宙规律的基础上进行的，天文观察的科学水平越高，对宇宙变化的规律认识和掌握越有根据，回族的自然哲学思想也愈能得到进一步的发展。像扎马鲁丁从西域所引进的最先进的天文仪器达7种之多，包括浑天仪、方位仪、钭纬仪、平纬仪、天球仪、地球仪、计时器，不仅促进了中西的科学交流，而且也发展了中国的天文、历算思想，使天文科学得到了进一步的发展，从而也促进了回族自然哲学思想的发展。
在回族自然哲学思想的发展中，有些人以科学的事实为依据，得出了唯物主义的结论，其哲学思想达到很高的境界，如明朝回族著名政治家海瑞的《治安疏》，就是一篇充满唯物主义思想的杰作。他在这篇文章里，对道教的长生不死的观念进行了无情的揭露。历史上曾经有过记载，嘉靖皇帝一度不理朝政，专求长生之术，幻想上天赐给他长生的“仙桃”、“天药”，海瑞以历史事实证明长生不老是没有也不可能有的事情。他在《治安疏》中说：“自古圣贤止说修身立命，止说顺受其正。盖天地赋予人而为性命者，此尽之矣。尧、舜、禹、汤、文、武之君，圣之盛也，未能久世不终。下之亦未见方外士汉、唐、宋存至今日，使陛下能得以访其术者”。嘉靖皇帝求长生之术是拜陶仲文为师的，海瑞在《治安疏》中讽刺道：“陶仲文陛下以师呼之，仲文则既死矣。仲文不能长生，而陛下独何求之？”海瑞在《治安疏》中，用事实揭穿了长生不老的骗局，指出“仙桃”和“天药”都是莫须有的。他深刻指出：“桃言采而得，药人工捣合而成者也。无因而至，桃药有足行耶？天赐之者，有手执而付之耶？”“区区桃药导之长生，理之所无，而玄修之无益可知矣。”海瑞的这些话，在自然观上有深刻的见解，对自然界的存在发展的客观规律作出了较为深刻的反映，批判了无知邪说，用实事求是的精神阐明了一些在当时看来极为流行而一般人无法作出回答的问题，在这一点上是有真知灼见的。
在回族的自然哲学思想中，有的哲学家在万物本原问题上带有鲜明的唯物主义倾向，提出了一些较为深刻的见解。如李贽在《焚书》卷三《夫妇论》中指出：“然则天下万物皆生于两不生于一，明矣。而又谓一能生二，理能生气，太极能生两仪，何舆与。”这里极其鲜明地指出，宇宙万物不是生于一，而是由阴阳二气所产生，“理不能生气”，这实际上是对当时盛行的理学家关于“理生气”的观点的有力批驳。他认为物质世界先于精神世界而存在，物质产生精神，不是精神产生物质，这是在思维和存在的关系问题上的正确见解。在程朱理学占统治地位的情况下，那时把“理”看成是高于一切的，处于至高无上的地位，认为物质世界由理所产生，理学家对这一点是深信不疑的。而李贽认为，物质世界生于气，坚持“气在理先”，而不是“理在气先”。他在《焚书》卷三《夫妇论》中又说：“夫厥初生人，惟是阴阳二气，男女二命，初无所谓一与理也，而何太极之有？以今观之，所谓一者果何物？所谓理者果何在？所谓太极者果何所指也？”在这里，仍然坚持“元气一元论”，极力反对有什么在阴阳二气之上的“理”的存在，认为物质世界不是由“理”所派生，而是由阴阳二气所构成。但在当时的历史条件下，李贽不可能提出物质是第一性的观点，从而在哲学基本问题上给予比较彻底的解决，他只不过是着重反对“理在气先？的错误观点，而在论证心与物的关系中，却陷入了主观唯心主义的泥潭。
回族学者的自然哲学思想，有它的历史功绩，其主要表现在对自然界存在和发展的规律有一些深刻的见解，这些见解在中国哲学发展的历史上有它一定的地位，为后人的研究提供了依据和材料。但是我们也不能不看到，在回族学者的著作里，有些地方也谈到了先天世界和后天世界的关系，在这一方面，往往陷入客观唯心主义的观点。关于“先天世界”，这是历来的宗教学者使用的名词，作为信仰伊斯兰教的回族学者也不能例外。他们是坚信先天世界先于后天世界的，物质世界是由先天世界所产生的，如刘智就把先天世界称为“无称”，认为“无称”是万物的本原。关于这一点，刘智在《天方性理》的“本经”中有这样一段话：“最初无称，真体无着。惟兹实有，执一含万。惟一含万，妙用斯浑。惟体运用，作为始出。真理流行，命昭气化。本厥知能，爰兮性智。一实万分，人天理备。中含妙质，是谓元气。先灭之末，后天之根。”在这段话里，“无称”如同黑格尔的“绝对观念”一样，在物质世界产生之前就存在着，由“无称”经过漫长的阶段而到先天世界再到后天世界，直到天地万物和人类的产生。当然，天地万物和人类也是由真主前定的，“真理流行，命昭气化”，都是真主作用的结果，人之性，物之理，是由“无称”在开始时寓于其中的妙质发展而来的，如此才有真理的流行。刘智正是从伊斯兰教的一神论的观点出发，构建了真主创造天地万物和人类的客观唯心主义哲学体系。在这个体系中，“真宰”（真主）是事物发展的起点，中间经过性与理（事物发展之理和人之所以然之性）的不断变化，最后又以真宰作为终点来判断一切、衡量一切、解释一切，这样，万事万物和人类都成了“真宰”意志的体现，这也是“真主独一”的思想的集中反映。这种客观唯心主义的哲学体系是在本体论上的神学一元论的表现，无论是马注还是马德新，都有类似的思想倾向。马注认为在太极和无极之先有一个“视之无形、听之有声、至玄至化”的“大能真主”，这大能真主成为天地万物的总根源，马惠新也认为阴阳元气、天地万物都是真主造化出来的，人和万物都由真主所安排，所有这些，都是神学目的论的反映。
三、在对事物的内部矛盾和运动发展上的朴素辩证法思想
在对物质世界的观察上，回族学者除了在自然界的存在发展的规律问题上有深刻的见解外，他们所提出的辩证法思想还论证了事物的内部矛盾，阐述了事物既对立又统一的观点，如李贽在《续焚书·与陶石篑》中说：“善与恶相对，犹阴与阳对，刚与柔对，男与女对，盖有两则有对。”这里讲的善与恶、阴与阳、刚与柔、男与女，还有在其他地方讲的天与地、乾与坤、夫与妇、曲与直、新与旧、治与乱、多与少等，都是指的事物内部的对立统一，在这方面具有朴素的辩证法思想。这一思想和前面已经阐述过的物质世界由阴阳二气所构成的观点是完全一致的。李贽还在《解老》中说：“若不曲，则不能全矣。引绳而直之，故以绳为直而不知其枉也。苟非枉，安能直哉？海洼也，而常盈，日月旧也而常新。饮酒食肉，少也而以饱以适，若务多不已，则吐秽随而反伤矣，是惑也。”在这里，不仅讲了事物内部的矛盾性，还包含了事物内部对立的两个方面可以相互转化的思想，这一思想不仅在自然观上表现出来，也在社会历史观上表现出来，如在讲到治与乱的关系时，他就有“乱极而治”的思想，认为社会是在一治一乱的矛盾中前进的，即“乱之终而治之始也。”在治理国家和提高人们的道德观念上，他也运用了事物内部矛盾及其相互转化的思想，要求在治理国家时“不蹈故袭，不践往迹”，使国家面貌不断发生新的变化。在提高人们的道德水平上，他还要求“日新而无敝，今日新也，明日新也，后日又新也。同时此心之故物，而新新不已，所谓日月虽旧，而千古常新者是矣。日月且然，而况于德性哉？”这段话来自《李氏文集·明灯道古录》，其中心思想是要求人们在道德上“日新而无敝，新新不已”，这无疑是要人们提高道德修养和道德情操，经常更新自己的观念，使自己的思想随着社会面貌的变化而变化，提高自己的道德境界。
回族学者还阐述了在人类认识过程中，从一般到个别、从个别到一般的辩证关系的原理，对生与死、性与命、形与神、善与恶等等，提出了较为深刻的见解，揭示了对立双方之间的内在联系以及在一定条件下的相互转化，这也具有朴素的辩证法思想。在刘智的《天方性理》一书中，还提到了大世界与小世界、天与人、先天与后天、性与理、体与用、有形与无形等概念，认为这些概念是“一分为二”又是“合二而一”的，他提出了“小中见大、大中见小”的思想，对大与小的关系作了深刻的论述。他说：“天下之物即至小如尘沙芥子亦必有内，有内则可以入乎其中而破之。”这里的见解极为深刻，阐述了微观世界也是可分的，他在200多年之前就有这些思想是十分可贵的。刘智还对物质世界和人类的产生发展与变化过程作了深刻的论述，他说：“首判阴阳，阳舒阴敛，变为水火。水火相搏，爱生气土。气火外发，为天为星。土水内积，为地为海。高卑既定，庶类中生。造化流行，至土而止。流尽则返，返与水合，而生金石。金与水合，而生草木。木与气合，而生活类。活与理合，而人生焉。气火水土，谓之四元。金木活类，谓之三子。四元三子，谓之七行。七行分布，万汇生成。殊行别类，异质分宗。理随气化，各赋所生。大化循环，尽终返始。故惟人生，独秉元精，妙合元真。理象既生，造化成矣。”在这一大段话里，表述了阴阳产生万物，从物质世界到人类的产生都是由元气发展而来的，有一个长期衍化的过程，在对这一发展过程进行描述时，他吸收了有关材料，利用了前人的科学成果，包含了一定的朴素辩证法思想。
