发光器还被用来迷惑敌人，保护自己。所谓敌人，既包括捕食者，也包括被捕食的对象。许多鱼如灯笼鱼的发光器多位于身体腹面。当它们夜间游到上层捕食浮游生物时，明亮的月光洒在海面上，若从下方往上看，海水有些发亮。一只不发光的鱼在月亮照射的海面背景上能很清楚地显示出它的黑色轮廓，很容易被其下方的捕食者所发现，凭敏锐的视觉对其攻击。鱼腹面的发光器一发光，就使自己和月光照射下的上部水色相一致，从而消除了本身的黑色轮廓，就不易被捕食者发现。这种效应称作消光效应。除鱼类外，乌贼及一些游泳虾类腹面的发光器都有这种效应。
许多灯笼鱼尾部的发光器也主要用来逃避捕食者。当被凶猛捕食者追捕或它本身发现有什么不祥之兆时，就用尾部发光器发出明亮的闪光，往往会使捕食者大吃一惊，当敌人迷惑不解地把注意力集中在闪光点上时，给了被捕食者一个逃跑的机会，被捕食者就趁机加速游开了。
事物往往是这样的，有矛就有盾。一些鱼可以通过消光效应而逃避捕食者，而另一些鱼则可以利用这种效应捕获食物。最典型的要算星光鱼。它一方面利用本身腹面的发光器产生消光效应，逃避捕食者，同时还有一双特殊的眼睛能识别出正在消光的鱼。星光鱼的眼方向是朝上的，眼里有一个黄色晶体，这实际上是一种滤光器，能将光波范围很宽的背景光过滤掉，识别出光波范围狭窄的有特殊颜色的生物光。当星光鱼向上方观察月光照耀下的海水时，一眼就能识别出正在用发光器消光的潜在猎物。这实际上正好利用了猎物的防御机制来捕获猎物。
