硬骨鱼类中能发光的种类最多。从中、下层已捕获的鱼类中,有4/5的种类有发光器,因此有人估计深海鱼至少有2/3以上甚至9/10的种类能发光。如灯笼鱼科、巨口鱼科、星光鱼科、柔骨鱼科、角鲼鲸科、黑巨嘴鱼科等42科的鱼类中有发光成员。发光器的结构也很复杂,如巨口鱼的腹部发光器,大都成杯状,底部是一层黑色的色素膜,再上是银色反光层,杯内容纳发光腺细胞团,灯笼鱼上方是滤色器和一个胶质聚焦晶体。当它发光时,每个发光器都通过晶体聚焦射出一个淡绿黄色光束,使光具有方向性。还有一个扇形光区,这显然是银色反射层反射而出的。发光器的数量很多,巨口鱼体上有100~500个发光器,而黑巨口鱼和星衫鱼还要多,达数千个。它们大大小小、星罗棋布,从小如针尖的发光组织遍布于全身甚至鳍上,到大型的沿腹面成行排列的杯形发光器,眼下和颊部还有更大一些的腺细胞发光。有些鱼如灯笼鱼的发光器上有神经分布,表明它由神经控制;另一些鱼的发光器没有神经分布,但所有发光器都有血液供应,因此这些鱼的发光器可能是由激素通过血液控制的。例如给黑巨口鱼注射肾上腺素,10分钟后所有发光器都发光。鱼类发光器发出的光颜色也不一样,有紫色、橘黄色、黄色、淡黄绿色或蓝绿色等,并常常时断时续,像一系列星光闪烁。
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