即便如此，要想在异国他乡活的更好，单靠大清没多大帮助：那只是一张遮阳伞，而不是安全屋。装装样子可以，冷暖自知。
俗话说靠山山倒，靠人人跑，只有自己最可靠。兰芳联邦立初期不过三千多号人，大多是贩卖货物的商人，金矿开采点的包工头和矿工们，居住点大多在靠近婆罗洲的西岸和北岸，从广东南海过来容易抵达的地方。经过十多年的发展，先前抵达的人回乡呼朋唤友的一起来开发这片热土，发展到现在已经有三万人之多。这里类似于桃花源，里面货真价实，明码标价，童叟无欺，从业自由，纳税规则简单明了，小市民经商、贩卖和养殖的税率按一百税五，如果按家庭计算，综合税率不超过十税一，而贸易商和金矿开采业主税率最高不超过百分之十五。
地方治理有赖于众人推举的大唐公署和理署。之所以称呼大唐公署，众人念想华夏子民，不管什么时候，身在何地都不能忘了自己的血脉，即便是漂泊万里。大唐公署设在首府东万律，公署设立财务司、政务司和法务所，三大机构互不干扰、相互独立，各有一套人马。财务司审时度势，制定和修订民、商通行规则；政务司则负责提供便民服务，维持秩序，征缴税务；法务所则负责调停纠纷，打击犯罪，保护诸人合法权益。
大唐理署作为分支机构，设立在三千人以上的居住点。公署处理重大民商案子，裁判官有三到五人。理署大多受理民商事案子，包括邻里纠纷协调处理，裁判官是一到三人。公署和理署都是有声望的族长、乡贤担任署长和裁判官，每届任期五年，可以连任，但任期不能超过三届。每月的初一、十五是公署和理署开门办案的日子，当然，重大案子由大唐署长召集。一般来讲，有理没理的在理署抽支烟喝杯茶，说个明白，什么仇怨都没了。如有故意挑起争斗，处理起来相当简单：情节轻微或没有造成严重后果者，以役代劳，发往种植园或矿上采矿；情节严重并造成严重后果者，立即押解发往周边无人荒岛，任其自生自灭。
总署特意从内地招徕团练，组建护卫队，对内维持秩序，对外打击海盗。行动队八百余人，表面人数不少，但大多是护院家丁类型，维持集市治安，看护矿场可以，真的上战场真刀实枪的拼杀，那是勉为其难。在兰芳联邦多次对外争斗中，输多赢少，大多赔钱了事。之前曾想让大清国派兵保护，只是大清自己的地盘都绥靖不止，哪有功夫分兵海外。兰芳联邦迫不得已从西班牙、葡萄牙、荷兰手里买了些火炮和枪械，布置在首府东万律城墙和一些黄金开采点周边，求个平安而已。
既然婆罗洲是顺着季风容易到达的地方，除了大清的人，当然还有从安南、柬埔寨、暹（xian）罗甚至英属孟加拉、西属菲律宾等地跑来讨生活的人，更甚者，葡萄牙、西班牙、荷兰和英吉利的武装船队，也会时不时兜过来看看有什么生意好做。
好在婆罗洲够大，西北角华人居多，是兰芳联邦的根据地和势力范围。而东北角为西班牙人控制。东南角为荷兰人控制。只剩下西南角属于三不管区域。
从第二舰队司令陈绍宽将军的汇报来看，荷兰人和英吉利人似乎对这个地方兴趣很大，常有两国的商队和武装船只在这片海域出没。兰芳共和国现在自保可以，对外拓展尤为艰难。婆罗洲东面就是西属菲律宾，岛屿的东北区域已经为西班牙人控制，东南大片区域已经为荷兰人占领。而如今，英属孟加拉的总督也开始关注这座巨形岛屿，时不时的派舰队来巡视一番。据说将派遣一支孟加拉部队登岛演习。既然如此，我南洋水师也不能袖手旁观，正好检验一下大清南洋水师的建设成效。
同治五年正月二十五，南院所在地成都府，召集陆军、两支舰队的少将级别以上人员参加会议，商讨出兵婆罗洲。
会议前一周，已和蒋百里、袁宗宝、邓世昌、陈绍宽等将领通过气，并听取了他们的建议。这次行动原本打算借助兰芳联邦的势力，只让水师出动解决。不过邓世昌提醒道：“水师行动范围有限只能打击海盗，围剿水贼，打击敌方沿岸势力，上岸后布置防务，清剿残余势力，还需陆军大力支持，为长久经营之计，还是水陆协同比较好。”
想想兰芳联邦只能自保的实力，还是算了，随便派自己的哪支队伍上去，都能团灭对方三次。于是采纳邓世昌的建议，让蒋百里会同陆军和水师将领，拟定出兵方案。
如今南院陆军已有十多万人，从中抽调三五千人马还是很轻松的事情。鉴于婆罗洲地方资源有限，总参部拟定：派遣陆军五千人，水师三千人，作战舰船和补给舰三十余艘，二月初二出发。陆军方面，从陆军第五师抽调四个营的兵力，从藏军十八师、缅军十九师、廓尔喀军二十师中各抽调两个营的兵力。由孙仁少将负责统一指挥。火力配置：火炮一百门，枪械四千支，长枪和弓箭五百具。水师方面，从第一舰队调派四艘大型作战舰艇，十艘中小型补给舰，从第二舰队抽调四艘大型作战舰艇，五艘中小型补给舰。混编水师指挥官为陈绍宽少将，负责海面绥靖和打击海盗行动，肃清婆罗洲西北和西南沿海的海盗，约束和规范各地商船和武装船只的行动。
这次行动目标特别明确：首先，接受兰芳联邦邀请，将兰芳联邦正式纳入南院保护范围，驻兵五百保护；其次，缉拿海盗，打击逃窜到婆罗洲南部沿海一带的海盗，并登陆作战，清剿海盗据点，维持当地秩序。最后，在婆罗洲西南沿海一带建立三到五个和平服务站，保护当地华人华侨合法经营，打击海盗，保障当地和平稳定发展。
随后，命人将行动纪要上报大清礼部，同时通报各藩国驻大清领事：婆罗洲清剿行动自大清同治五年二月初二启动，同年五月五日结束。婆罗洲周边水域出现的大小水面舰艇船只，不论商船还是军用舰船，须按战时规则，接受南洋水师登临检查，有无违禁军械物品输入。如遭遇舰只非法强行突破，或有其他逃避检查行为者，即视为通敌舰船，一律击沉！缉拿海盗人人有责!大清南洋水师五年正月二十五
