此时的新西伯利亚之战已进入僵持阶段，大清新军占据东城，而沙俄则占据西城，双方时不时的隔江对轰。而在新开辟的鄂木斯克州和秋明州战场，因沙俄顿河哥萨克兵团的大量增援，战线推进到伊西姆便陷入僵局。此地距离秋明州首府不过两百多公里，只是随着战事持续向西推进，兵力逐渐分散，原本五个师的兵力，现在只有两个师不到一万余人进攻，而两个师需要分兵把守占领的城池，还要提防沙俄哥萨克骑兵团对交通运输的袭扰。尤其是进入冬季后，物资供给更为艰难。为避免被沙俄分割包围，福康安命西征军战线收缩，撤回至鄂木斯克州，此地西距秋明州府五百公里，到新西伯利亚城距离相当。大清四个师的兵力在此地固守，作为大清的前出哨，犹如一把楔子，插在北极熊的腹部，使其不敢过于张狂。
只是天算不如人算，福康安没料到会有一支奇兵直插大清京师腹地。总参蒋百里之前有过提醒：要提防沙俄从西伯利亚北线迂回，攻击大清腹地。只是福康安有些轻敌了。一则，北院新军战力虽不比南院新军强悍，但据城自守应问题不大。再则，低估沙俄冬季机动作战的能力，犯了经验主义错误，拿大清自身的局限在评估沙俄的战力，忽略了老毛子“北极熊”的特性：在冬季野外作战实力和保障方面，都要比大清高出许多。尤其是哥萨克骑兵团，在严寒条件下的忍耐力和作战意志力惊人。三则，按照后世历史进程，沙俄凯瑟琳女皇应该在初冬时候表演“天外飞仙”，则沙俄将陷入内部纷争，对外再无更多的攻击能力。谁知福康安这只小蝴蝶引发历史偏差：凯瑟琳女皇一口气多吊了一年。而这一年却让福康安吃尽苦头：沙俄对外用兵有增无减，尤其是对大清的征伐，似滔滔江水绵绵不绝，如同捅了马蜂窝一样。
福康安收到京师发来的快报后，陷入两难境地：如放弃占据的沙俄领土，则沙俄势必会卷土重来，或许会变本加厉的反击，有哥萨克骑兵团这只尾巴跟着，即便撤退，也不会走的舒坦。其次，哈萨克汗国因提供通道便利，已经被沙俄惦记上，如大清仓促撤退，则哈萨克汗国也将陷入灭顶之灾。再者，即便现在回援，从乌里雅苏台到京师近两千多公里的路程，等大队人马赶到京师，黄花菜也凉了。再则，以疲惫之大清新军对阵以逸待劳的沙俄和东瀛联军，胜负难料。
权衡再三，福康安、蒋百里等人决定将计就计，督促驻蒙古陆二十八师吴德林部，驻青海陆二十三师孙明谨部向张家口方向集结。陆五师陈耿部、二十九师马占山部则自北海（乌兰乌德）出发，收复被沙俄侵占的嘉定（赤塔），截断列普宁所率沙俄大军的退路。如列普宁识趣提前解围京师，绕道东北返回沙俄，还有生还的机会。若顽抗到底，只能将沙俄五万人马埋在京师城下。毕竟京师城墙厚实，护城河也有数丈宽，再者沙俄多是火枪营和骑兵营，火炮稀少，若没有好的攻城器械，凭借十五阿哥的数万大军，坚守两个月和南院新军来个里应外合，不难将沙俄大军剿灭城下。
此时的京师已被沙俄军队团团围住。列普宁率沙俄军队进入大清后，一路横冲直撞，竟也缴获不少北院新军的火枪火炮。尤其是山海关一战，沙俄前锋古多维奇率军一万余人，三日便攻破城门，打开通往京师的门户。此战缴获近百门火炮，成为日后攻克京师城防的利器。
沙俄列普宁将军能做到元帅的位置，也不是泛泛之辈，深知战事持续越久，对沙俄大军的处境愈加不利。所以在数日猛烈炮轰后，便派出使团向十五阿哥下达最后通牒：如即日宣布开城投降，不但能保住皇位，更能保全城中百姓性命。若继续顽抗，则城破之日，也是大清北院皇室宗亲灭门之时！
四九城现在已是一座孤城，满城的皇亲国戚和八旗子弟都惶惶不可终日，听闻沙俄凶残成性，不知是战还是和。不过有一点是确定的：无论是枪支弹药，还是其他作战物资储备，都只维持在一个基本的战斗储备水平，开打不消十天便消耗殆尽，那时候火枪和火炮都将只是摆设。而京畿附近援军要么迟迟未到，要么已被沙俄哥萨克骑兵拦截后被驱散。即便有外国商队进出京师，都受到沙俄军队的阻拦，所有物资一律就地征收。
在遭遇沙俄攻击十多天后，十五阿哥等人对固守待援的想法已不抱希望。再者满清宗室和蒙古旗主对沙俄的攻击力已产生极大恐惧，早已将开战初期的胜利抛到九霄云外。
“十五阿哥，现在我等被沙俄围困，实则事出有因，那福康安为一己之私欲，引来沙俄这豺狼，实乃借刀杀人，其心可诛！卑职建议和沙俄停战，护我江山社稷之周全。即便赔上点土地和银两，只要我大清社稷永存，不愁没有翻身的时候。”兵部尚书王哲说道。
十五阿哥永琰对此不置可否。兵部尚书只能向刘墉、和珅等人求助。刘墉眼看十五阿哥仍在犹豫，便上前说道：
“十五阿哥，俗话说攘外需先安内，外患如手足之冻疮，过些时日还可恢复，而内患如腋下之患，随时危及我社稷安危。现如今福康安实力强大，对我北院，如有可能，不妨借助沙俄和东瀛人之手将其剪除。”
十五阿哥思虑半天终无良策，于是凄然惨笑道：“不论是真心为大清江山社稷着想，还是为你们自己的顶戴和家人考虑，我都不会怪罪你们，要怪只能怪自己识人不明，用人不善！文官不贪财，武将不怕死，如我有福康安一半的贤臣良将，又怎会有城下之盟。罢了，这事你们看着办吧！”说罢，拂袖而去。
而曾经风华绝代的老头子已进入帕金森症晚期，对时务毫无感应。
三日后由北院军机处发出停战通告，宣布单方停火，并接受沙俄停战协议：
甲清国、沙俄帝国和东瀛三国，结为亲密友邦。
乙十五阿哥为清国唯一合法帝位继承人。南院执政福康安为清国反叛势力，应清国皇帝邀请，沙俄帝国军队、东瀛军队将协同清国军队，对福康安反叛势力进行围剿。
丙为表达沙俄帝国的诚意，现将贝加尔湖以东区域，包括乌兰乌德、赤塔、尼布楚等地交还大清北院。（此地现已被福康安南院新军占领，所谓交还不过是有名无实，有本事你自己去拿过来）
丁清国为感谢沙俄帝国的帮助，将外兴安岭以北地区赠送给沙俄，同时筹集五千万两的白银或实物作为沙俄军队帮助剿匪的开支，该款项分三年偿付。
丙为感谢东瀛帝国的帮助，将朝鲜国宗主权让渡给东瀛，并将库页岛赠送，同时筹集一千万两白银或实物作为东瀛军队帮助剿匪的开支，该款项分三年偿付。
丁海参崴、庙街、旅顺、塘沽等港口开放为自由港，允许沙俄舰艇、东瀛舰艇自由出入。
戊将七里屯事件的肇事者安德烈上尉、叶菲姆少尉交给大清北院处置。
