戊鹿儿岛港附近一千平方公里为自由贸易区，由大清、德川幕府直属共管。荷兰、英吉利、西班牙、葡萄牙可申请租借作为贸易、仓储经营使用，租借面积不超过一百平方公里，租期十年，可续租。租金按当地通行标准执行。
鹿儿岛区域是大清南院一万余将士生命代价换回来的，放弃只会遭受国人唾骂。现如今只是占领鹿儿岛附近区域而已，而萨摩藩的其他区域占领部分，在停战条约生效后三年内会陆续退出。但鹿儿岛附近区域务必保留共同管辖，按东西区域划分，西部区域划归大清南院管辖。东部区域归德川幕府管辖。而荷兰、英吉利、西班牙和葡萄牙等国家则按约定内容执行。
全数支持，通过（德川幕府免费分得半个鹿儿岛直管区域，双手赞成）
巳岛津重豪、西乡隆盛和东乡平八郎等发动和策划清萨战争，按叛国罪判处斩立决。
德川幕府提出严正抗议，并表示强烈不满！
德川幕府对此提出强烈不满！岛津重豪等人即便发动战争，但也非叛国行为，如因此定叛国罪处罚，则东瀛国人难以释怀，必定不利于和平。想想也是这个道理。但若没有这三人，则多少萨摩藩武士、大清将士和琉球民众可以安度晚年，享受田园乐趣。再怎么为萨摩藩民众考虑，也不能安然脱罪。
最后，采取折中方案：岛津重豪、西乡隆盛、东乡平八郎因触犯战争罪，导致萨摩藩人员和财产重大损失，以及睦邻关系遭到破坏，判处终身监禁，反思战争罪行。监禁地点：大清直属婆罗洲特区附近的古晋岛（为三人人身安全考虑，远离东瀛和琉球）由大清、德川幕府和第三方（英吉利、荷兰）三方共管，各出二十人，监禁期间护理费、营养费按十万两每年计算，由萨摩藩出资。岛津重豪等人携带家属或亲随不超过十人，每三年可安排家属探亲一次。
全数支持，通过。（德川幕府算是扳回一局，没有对岛津重豪、西乡隆盛等三人及其追随者人道毁灭已是恩典）
庚赔偿琉球王国物资损失费五百万两。
琉球王国现如今一穷二白，这局面是谁造成的？当然是萨摩藩一百余年的统治造成，若非过去刮地皮式的横征暴敛，琉球王国应似后世迪拜富裕。按过去每年贡银五十万两，十年五百万两，由萨摩藩支付赔偿，多吗？要不要二十年甚至一百年的账全部收回？
如此一算，还算公平。只是五百万两还是有些多。最后打八折，按四百万两，分二十年赔付。由德川幕府先行垫付，再从萨摩藩税务、土地收益权中逐步收回。
全数支持，通过。（交易双方是双赢的，至少德川幕府的收益有保障）
一周后，停战协议最终达成，对外公布几条框架协议（具体内容你懂得，不便对外公布）：
甲尊重琉球王国领土和主权完整。琉球王国包括奄美群岛、中山群岛、宫古群岛和八重山群岛等海域岛屿。
乙东瀛支援琉球王国经济发展建设，提供大量无偿贷款援助。
丙为太平洋地区长久和平，消除战争隐患，调整萨摩藩部分人员的岗位职务。岛津重豪卸任萨摩藩大名职务，由其子岛津齐宣继承。
丁建设鹿儿岛自由贸易港。大清南院和德川幕府开展一对一合作对话，英、荷、西、葡等国积极参与，谱写鹿儿港未来新篇章。
德川幕府对东瀛国民宣称：凭借武力优势作为坚强的后盾（真有那么强就不要谈），不费一兵一卒，迫使西清做出重大让步，西清将会从鹿儿岛撤兵（隐藏内容：自协议生效之日起三年内，撤出一大部分兵力，仅保留三千驻军）这次谈判堪称是我东瀛外交的一大胜利（德川将军府库受益多多，赤字状况改善）！
而福康安一行，则对众人说道：和平来之不易，且行且珍惜！将士们可以回家见你们的亲人了！
《鹿儿岛停战合约》经大清南院、德川幕府和第三方见证人（英、荷、西、葡等国使节）代表签字后，交还协约，于五月一日正式生效。
按照协约和补充内容要求，尚穆王回到了琉球王国，琉球王室的珍宝自然下落不明，萨摩藩岛津齐宣则从府库中拿出十万两作为赔偿。一千四百万两赔偿款，分期五十年赔付，加上年息百分之五，按每年三十万两支付给大清南院，由德川幕府十年一次先行垫付，合计三百万两白银，于条约生效起一个月内支付，也已完成交割。而对岛津重豪、西乡隆盛和东乡平八郎等三人的安置，则花费十天的时间，敲定随行家属和追随者名单，于五月十日出发，前往婆罗洲特区监管区域，终身监禁。该岛面积约数十平方公里，有山川树木花鸟虫鱼，岛津重豪等人虽然并不甘心，但德川将军已叮嘱过，为萨摩藩后代和部众安全着想，还是找个地方安度余生为好，否则大家都会很难看。这已经是为他和他的家人所争取的最大化利益。想想那些死在他手下的亡魂，数万琉球民众，数万战死的萨摩藩将士，数万伤亡的大清将士，从某种程度上讲，他已经完成自身的历史使命，可以安然告退人生舞台，眼下的他，只是在等待某个节点的到来。于是乎，岛津重豪开始渔业研究，如何养鱼，还让人将西洋的天文学著作拿来一读。而西乡隆盛则看得更淡然些，开始钻研佛学和金石学，放下一切，随心随缘。
只有东乡平八郎，整日里愤愤然牢骚不停，见人就要说几句，只是这里的看护人员都得到命令：不得回复此三人讲话，尤其是东乡平八郎，否则按泄露军事机密罪处置。
各国使节在协议交换完成后，除几名代表外，其他舰艇人员先后离去。
江户幕府将军德川家齐率东瀛水师开始环东瀛列岛，尤其是关西地区的诸侯大名，都受到特别关照。绕行东瀛列岛八十天，收获颇丰，四位关西地方大名因征缴不力、不遵从号令受到责罚，贡献税银合计二百万两，而萨摩藩借款，以及出让日向藩和大隅藩收益，贡献税银近百万两，德川将军府增收近三百万两。德川家齐偶尔也会产生这样念头：如果不是敌对关系，真希望福康安多来两趟。
大清南院陆六师、陆十六师从萨摩藩地方陆续撤军。当然，在撤出之前需要对当地的政治土壤做些调整，扶持开明绅士和中下层武士上位，是撤退计划的一部分。只有分裂的萨摩藩，乃至九州岛，才符合大清利益的最大化。岛津重豪的时代已过去，而岛津齐宣接任不久，对萨摩藩的人事权还未充分掌握，正是扩大大清南院在萨摩藩影响力的最佳时机。
鹿儿岛区域的安全防护已经交给陆八师苏宇部负责，有苏宇沉稳干练的将领在，既能稳定军心，又不会惹出幺蛾子。而德川幕府则将鹿儿岛安全防护仍交给岛津齐宣来处理，只是岛津齐宣须每年缴纳高达十万两的税赋，作为岛津家族在鹿儿岛存续的代价。
大清在东瀛获得一个立足点，德川幕府则借此清除一个顽固诸侯据点，而英荷西葡等国也因此打开一条通往东瀛的贸易通道，只有萨摩藩从此一蹶不振。
自此，萨摩藩战事正式落下帷幕。
