就在大家摩拳擦掌，准备解开阿波丸沉船宝藏之谜时，新华社受权发布了一条电讯：从1977年开始的清理牛山岛渔场水下障碍物，打捞日本沉船阿波丸残骸的作业，经过三年时间，已基本完成。
正在上海奉命组建海洋水下工程研究院，以便为打捞阿波丸沉船提供技术支持的张智魁闻讯后，深为震惊。在《掘海人》一书中，光明日报社资深记者、报告文学家李树喜动情地写道：
张智魁以总指挥的名义严肃询问负责作业人员：
“找见资料记载的四十吨黄金，十吨白金，五箱钻石，五十箱珠宝了吗”
“没有找见！”
“为什么不找了呢”
“经判断没有，因此不再耗费气力！”
张智魁火了，狠狠地瞪起了眼睛。
“你们到过船长室吗没有！到过贵宾室吗又是没有！找到那四至六个保险柜了吗也没有！这些极大可能存放贵重物品的地方没有探到，凭什么宣布这些东西不可能存在而停止寻找了呢你们要明白，数十吨的黄金、白金，只占很小的空间，甚至有可能焊在某舱的夹层里，你们没有去找，怎能判断没有呢”
对方支吾，无法回答他那雄辩的，一针见血的问！
“有没有捞取全部船体计划”
“没有，已经决定停止，公开宣布了！”
不用解释，这便是报上那则公告。他愤怒了，他还许久没有这样震怒过，这不仅对他而且对整个中国打捞业来说是一种耻辱！他痛心，他孜孜以求、劈波斩浪去追求的美好计划破产了，揭谜的设想又变成了一场梦。当然，他所着眼和追求的绝不是那资料记载的大宗珠宝，而是潜水打捞向深、向细、向成熟发展突破的关键一步，它能取得重大成功的经验，同时也能锻炼一支坚强的队伍，这是比黄金更为珍贵的啊！
本来，就我们的队伍、设备、技术来说经过努力是完全有可能彻底捞起沉船的，然而当作业需要勇敢地前进一步时，他们却“勇敢”地退却了，而且唱了一曲得胜回朝的凯歌。
他像被人重重地一击，头晕目眩！
是有意挫败张智魁当初雄心勃勃的计划，还是害怕困难、害怕劳而无功为人耻笑或被上级指责呢张智魁一直冥思苦想，猜测作业主持者半途而止的原因。
是啊，他理解，他们也有自己的难处，那是冒风险的事业啊！胜利只属于敢于冒险进取的人，何必责怪别的人呢他又宽慰他们，也好像在劝慰自己。
中国人并没有打破泥沙寻到底，珠宝、金银没有捞取出来，阿波丸还在牛山岛波涛之下！
这是谜中之谜啊！张智魁眼睛突然亮了：阿波丸还在，我张智魁还在，留得大海在，不怕没船捞。我一定要把阿波丸全部打捞出来！
我张智魁总有一天要揭开这谜中之谜！
有识之士仍在呼吁
阿波丸沉船打捞工程，历时三年多，工程巨大，影响深远。虽然没有达到预期目标，却取得了不菲业绩：海军、交通部、国家有关部门科研人员共有3000多名参与，其中，海军J101号、J503号船和上海救捞局沪救3号船，各船平均作业332天。共有600多名潜水员进行了水下作业，轮番下水总数达13604人次，水下作业6138小时，超过下潜100次的潜水员有64人。水下切割2379.1平方米，水下爆破650次。清除沉船上的淤泥12291.5立方米，揭盖4974平方米，约占沉船船体面积的70%。打捞出橡胶、锡锭等货物总计达5417.947吨，其中仅锡锭一项就达2872吨，可以换取4000万美元。所得财富，大大高于国家的投入。
当然，在400多个日日夜夜里，所有参战人员战风斗浪，付出了巨大的辛苦。还有两名潜水员光荣牺牲。
为了搞好后勤保障，平潭县群策群力，先后为各作业船队提供了47万斤各类主副食品。
1979年7月、1980年1月和1984年4月，中国政府本着中日友好和人道主义精神，充分体现中华民族的宽容大度，先后三次在上海向日本方面移交了阿波丸沉船死难者的遗骨370具和私人遗物218项，共计1683件。
1979年7月2—4日，日本厚生大臣桥本龙太郎（1996年起任日本政府首相）率领包括8名死难者家属的代表团，相继访问北京、上海。在北京，访华团分别拜会了国务院副总理陈慕华、外交部部长黄华、交通部部长曾生。死难者家属代表呈交了致中国领导人和有关方面的感谢信。7月2日晚，在人民大会堂为访华团举行的欢迎宴会上，桥本龙太郎大臣诚挚地说：“贵国政府本着日中友好和人道主义精神，决定将阿波丸遗骨交给我们。我国政府对贵国政府非常感谢。日本全体国民，特别是阿波丸沉船死难者家属对贵国政府感激不尽。”
1981年4月25日至5月6日，在上海举行了第三次、也是最后一次的阿波丸死难者遗骨遗物交接仪式。4月30日，当死难者家属代表、东京电视台摄影员山中来到私人遗物陈列室时，他三步并作两步，走到摆放着遗物的桌前，双手捧起一个“牌位”，眼含泪花，激动得说不出话来。经过交流，中方交接人员得知，当年，山中的祖父在新加坡病故，他的父母接到噩耗前去奔丧，这个“牌位”，是他父亲亲笔书写的。当阿波丸起程回国时，他的父母得到好友帮助，才买到了两张船票。可是，船未抵达日本，阿波丸就沉没了，他的父母带着“牌位”，遇难身亡。真是不幸之中，又遇不幸。46岁的山中对中方人员深深鞠躬，十分感激地说：“我真没想到，今天在上海能得到这样一件珍贵的遗物。我太感谢中国救捞工人啦！”
阿波丸沉船打捞工程告一段落，然而，关于黄金、白金、工业钻石和“北京人”头盖骨化石等贵重物品的去向，却成为世人争议的新焦点。曾参与打捞工程组织、指挥的张代吉（交通部救捞局巡视员、交通部潜水员考核委员会常务副主任）认为有四大可能：
第一，当年宝藏运输采取了声东击西之策，并未装上阿波丸，而是由其他渠道运回了日本。
第二，由于最初的情报和资料有误，以讹传讹，那些宝藏也许根本就不存在。
第三，打捞人员曾在船舱内发现一只腐蚀的潜水鞋底，以此联想到阿波丸可能已经被人盗捞过，但在战争期间，日本、台湾、香港、澳门等国家及地区，当时并不具备这样的打捞条件和能力；美国虽有能力打捞，但按照美国的惯例，60多年后早该解密，其打捞情况一定会公之于世；新中国成立后，牛山岛海域一直在中国的监控之下，如有可疑外籍船舶在此海区进行较长时间的抛锚作业，应当会被发现，并被驱逐，所以，有人认为潜水鞋底是船上自用的，而不是盗捞者落下的。
第四，阿波丸可能设有自爆装置，遇到紧急情况自动装置引爆，船体破坏极大，因此在顷刻间沉没。如果价值连城的财宝是在新加坡装上阿波丸的，那么，仍在沉船残骸里面的可能性微乎其微，极大可能是，在剧烈爆炸和强大的海水冲击作用下，这批宝物已散落在阿波丸沉没附近的大海深处，并覆盖了厚厚的淤泥，难以搜寻。
而张智魁、李树喜等阿波丸研究专家，却坚信无风不起浪，黄金、白金、工业钻石和“北京人”头盖骨化石等贵重物品，仍然静静地躺在牛山岛海域的某个角落，等待着人们的再次打捞。
出于责任感和使命感，这些年来，他们一直没有停止呼吁。张智魁向国家有关方面提交了《打捞阿波丸沉船可行性报告》：“如果我们不能尽快掌握处理深海舰船、石油平台、海底输油管线事故的潜水与打捞技术，我们的海洋活动将受到极大的局限。而利用阿波丸练兵，则是一举多得的捷径。……通过再次打捞阿波丸，中国可以借此建造一个多功能饱和潜水母船，集自航、铺管、饱和潜水于一身，填补国内空白。”他还进一步指出，“我国仅有一个水下考古队，捞宝力量有限，国家的海上救捞局职责主体是救捞而非打捞。那么多的海底宝藏怎么办难道任由其流失和毁坏堵不如疏，如果在放宽政策的同时加强监管，国家不花一分钱、不承担一点风险，就能获得大量水下的无价之宝。”
李树喜更是利用各种机会，广为宣传：中国打捞阿波丸只是吊起船头，切割爆破，打捞到第六舱，还有三分之二的沉船残骸没有捞起，沉船上还有许多地方潜水员根本进不去。在《双Ｘ档案——北京人失踪和阿波丸沉没》中，他通过考证，认为“北京人”头盖骨化石就在阿波丸沉船上。他说：“以前阿波丸号打捞工作曾存在的技术问题，现在已经获得解决，打捞前期要投入的5000万元到一个亿的资金也不是问题。目前的工作主要是，要获得国家的批准和相关政策的支持。我们希望同民间进行合作，通过商业运作、自筹资金、风险自担、国家批准、利润分成的形式，完成这个工作。”
看来，要破解阿波丸的所有谜团，只有一个办法，那就是将阿波丸沉船全部、干净、彻底地从海底打捞上来，重见天日。
但愿这一天早日到来！
